More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1898 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
328 aa  650    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.8 
 
 
320 aa  320  3e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
320 aa  317  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
351 aa  233  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.38 
 
 
305 aa  219  7e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  37.38 
 
 
305 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02948  oligopeptide transporter permease  38.05 
 
 
306 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002960  oligopeptide transport system permease protein OppB  38.24 
 
 
291 aa  216  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0610  oligopeptide transporter permease  38.68 
 
 
306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
307 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1959  oligopeptide transporter permease  36.48 
 
 
306 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162478  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1480  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppB  36.25 
 
 
307 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2162  oligopeptide transporter permease  36.48 
 
 
306 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136059  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0149  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
304 aa  204  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.160386  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2029  phosphoglycerate mutase 1  37.93 
 
 
311 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664114  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
335 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
307 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591349  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2889  alkaline phosphatase  35.94 
 
 
307 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2069  oligopeptide transporter permease  36.48 
 
 
306 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.186457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
307 aa  202  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.298513  hitchhiker  0.00733729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.04 
 
 
333 aa  202  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1873  oligopeptide transporter permease  36.68 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.741835  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1400  oligopeptide transporter permease  36.68 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1936  oligopeptide transporter permease  36.68 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1582  oligopeptide transporter permease  36.68 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.733786  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
326 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00478237  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0591  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.42 
 
 
308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.101579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1986  oligopeptide transporter permease  36.99 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0022  alkaline phosphatase  34.91 
 
 
306 aa  199  5e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1879  oligopeptide transporter permease  36.36 
 
 
306 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675854 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4686  alkaline phosphatase  37.46 
 
 
307 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0426131  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2287  oligopeptide transporter permease  36.99 
 
 
306 aa  199  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
326 aa  199  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2700  oligopeptide transporter permease  36.68 
 
 
306 aa  198  9e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0475614  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01218  oligopeptide permease ABC transporter membrane protein  35.85 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2404  Alkaline phosphatase  35.85 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000374689  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1896  oligopeptide transporter permease  35.85 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22801  normal  0.152903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1730  oligopeptide transporter permease  35.85 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal  0.0825578 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1392  oligopeptide transporter permease  35.85 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.897764  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2384  oligopeptide transporter permease  35.85 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.423477  hitchhiker  0.00000144694 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01228  hypothetical protein  35.85 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1353  oligopeptide transporter permease  35.85 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00072076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1413  oligopeptide transporter permease  35.85 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.933952  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2420  nickel-transporting ATPase  36.45 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827843  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2301  oligopeptide transporter permease  35.42 
 
 
306 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  33.12 
 
 
305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
308 aa  195  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46607  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
308 aa  195  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  37.12 
 
 
324 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  38.07 
 
 
326 aa  195  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
319 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
319 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.692549  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
308 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
305 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
308 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1953  oligopeptide transporter permease  36.05 
 
 
306 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2194  oligopeptide transporter permease  36.36 
 
 
306 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0464785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
307 aa  193  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
309 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0336  ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 
306 aa  192  5e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0225977  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
325 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
339 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1404  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  37.89 
 
 
307 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
311 aa  189  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.679809  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0391  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.1 
 
 
303 aa  189  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.920936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
309 aa  188  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3654  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
304 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276261  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003658  oligopeptide ABC transporter permease protein  40.3 
 
 
266 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0570  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
308 aa  187  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.81 
 
 
313 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
307 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00227736  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
332 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7029  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  35.31 
 
 
307 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
307 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
321 aa  186  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
319 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.21 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
319 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
309 aa  183  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000243016  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 
319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4405  alkaline phosphatase  35.11 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
313 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
305 aa  182  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
319 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4107  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.36 
 
 
309 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
339 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0777268  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1235  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.36 
 
 
309 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
321 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
318 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3600  alkaline phosphatase  35.31 
 
 
307 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>