More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1224 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 335 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.56 
 
 		 307 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.96 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  43.33 
 
 		 305 aa  270  4e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  43.33 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.17 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000243016  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 		 306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.21 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2420  nickel-transporting ATPase  38.76 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827843  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.7 
 
 		 305 aa  235  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121257  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 		 307 aa  231  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4686  alkaline phosphatase  37.2 
 
 		 307 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0426131  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.12 
 
 		 307 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.298513  hitchhiker  0.00733729 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00478237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 		 306 aa  227  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000794188  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2029  phosphoglycerate mutase 1  37.13 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2162  oligopeptide transporter permease  37.43 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136059  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1959  oligopeptide transporter permease  37.43 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1986  oligopeptide transporter permease  37.13 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2069  oligopeptide transporter permease  37.43 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.186457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2287  oligopeptide transporter permease  37.13 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289151  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.4 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681707  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2301  oligopeptide transporter permease  36.53 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1953  oligopeptide transporter permease  37.13 
 
 		 306 aa  221  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2700  oligopeptide transporter permease  36.53 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0475614  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2194  oligopeptide transporter permease  36.83 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0464785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.472252  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1480  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppB  36.28 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000653909  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591349  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 		 311 aa  219  6e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.679809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2889  alkaline phosphatase  35.69 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1413  oligopeptide transporter permease  35.63 
 
 		 306 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.933952  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01218  oligopeptide permease ABC transporter membrane protein  35.63 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2404  Alkaline phosphatase  35.63 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000374689  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1730  oligopeptide transporter permease  35.63 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal  0.0825578 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1353  oligopeptide transporter permease  35.63 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00072076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01228  hypothetical protein  35.63 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227767  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1896  oligopeptide transporter permease  35.63 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22801  normal  0.152903 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1392  oligopeptide transporter permease  35.63 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.897764  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2384  oligopeptide transporter permease  35.63 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.423477  hitchhiker  0.00000144694 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1936  oligopeptide transporter permease  35.93 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1873  oligopeptide transporter permease  35.93 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.741835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1400  oligopeptide transporter permease  35.93 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1582  oligopeptide transporter permease  35.93 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.733786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1879  oligopeptide transporter permease  35.93 
 
 		 306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675854 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0610  oligopeptide transporter permease  34.73 
 
 		 306 aa  215  8e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1404  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  36.61 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 		 324 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02948  oligopeptide transporter permease  34.43 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0591  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.39 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.101579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.63 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0536  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178861  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0466  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3600  alkaline phosphatase  35.03 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0022  alkaline phosphatase  35.03 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.67 
 
 		 325 aa  210  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7029  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  38.62 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 		 308 aa  209  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0639  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0149  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.53 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.160386  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.950379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 		 320 aa  205  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  33.98 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  33.33 
 
 		 305 aa  205  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002960  oligopeptide transport system permease protein OppB  35.46 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  34.96 
 
 		 326 aa  202  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4405  alkaline phosphatase  37.72 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 		 333 aa  202  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  32.33 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46607  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0336  ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0225977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  35.65 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2593  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.34 
 
 		 343 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0842  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.65 
 
 		 297 aa  199  7e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00690225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4107  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  32.51 
 
 		 339 aa  198  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1301  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.67 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  32.51 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  32.51 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1235  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>