More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0632 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
392 aa  814    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.02 
 
 
394 aa  511  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.91 
 
 
370 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.81 
 
 
375 aa  455  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.47 
 
 
374 aa  455  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.79 
 
 
369 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.92 
 
 
373 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.84 
 
 
373 aa  451  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.58 
 
 
373 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.21 
 
 
373 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.34 
 
 
357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.77 
 
 
372 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.61 
 
 
379 aa  442  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.07 
 
 
380 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.51 
 
 
380 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.67 
 
 
370 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.43 
 
 
372 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.94 
 
 
379 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.94 
 
 
379 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.94 
 
 
379 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.94 
 
 
379 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.94 
 
 
379 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.94 
 
 
379 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.94 
 
 
379 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.14 
 
 
372 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.51 
 
 
379 aa  431  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.94 
 
 
379 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.94 
 
 
379 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.94 
 
 
379 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.22 
 
 
367 aa  432  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.57 
 
 
392 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.04 
 
 
371 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.79 
 
 
384 aa  429  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.28 
 
 
392 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.1 
 
 
384 aa  424  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.81 
 
 
379 aa  425  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.28 
 
 
392 aa  425  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.72 
 
 
383 aa  426  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.19 
 
 
371 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.81 
 
 
379 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.34 
 
 
382 aa  422  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.81 
 
 
379 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.77 
 
 
370 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.09 
 
 
379 aa  421  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.29 
 
 
372 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.67 
 
 
387 aa  419  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.64 
 
 
369 aa  418  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.08 
 
 
388 aa  416  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.98 
 
 
372 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.39 
 
 
380 aa  413  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.07 
 
 
374 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.11 
 
 
380 aa  411  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.19 
 
 
387 aa  408  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.42 
 
 
376 aa  408  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.74 
 
 
407 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.02 
 
 
388 aa  408  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1321  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.93 
 
 
391 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.61 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.31 
 
 
384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.51 
 
 
369 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.36 
 
 
355 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.12 
 
 
373 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.05 
 
 
376 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.34 
 
 
385 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.6 
 
 
394 aa  399  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.57 
 
 
383 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.15 
 
 
380 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2542  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.11 
 
 
387 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1307  queuine tRNA-ribosyltransferase  51 
 
 
387 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.3 
 
 
383 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.48 
 
 
365 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 
395 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.37 
 
 
368 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 
370 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.97 
 
 
372 aa  397  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1408  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.75 
 
 
387 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.971065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 
368 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.96 
 
 
381 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.03 
 
 
374 aa  395  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.44 
 
 
367 aa  395  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1430  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.72 
 
 
376 aa  396  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.876583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4079  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.02 
 
 
376 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.137728 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.92 
 
 
380 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.92 
 
 
380 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 
377 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6918  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 
376 aa  388  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.625358  normal  0.464203 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
372 aa  388  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1267  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
373 aa  388  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.49 
 
 
377 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1290  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.78 
 
 
375 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.65 
 
 
378 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.4 
 
 
386 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  50.13 
 
 
382 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 
380 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
384 aa  385  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.22 
 
 
371 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.38 
 
 
375 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14600  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.93 
 
 
372 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2335  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.81 
 
 
386 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.0584055 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.22 
 
 
371 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>