More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1267 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1267  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  100 
 
 
423 aa  859    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0986  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  34.04 
 
 
368 aa  184  3e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000000927253  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  34.7 
 
 
383 aa  180  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.85 
 
 
378 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4214  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  31.31 
 
 
403 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2396  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  33.42 
 
 
375 aa  172  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000351393  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04270  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.53 
 
 
389 aa  172  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.81 
 
 
378 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04920  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.07 
 
 
389 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.95 
 
 
379 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0815  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.82 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.34 
 
 
390 aa  167  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.16 
 
 
387 aa  166  9e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.17 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
388 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.16 
 
 
387 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.4 
 
 
389 aa  164  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.3 
 
 
389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.66 
 
 
386 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.91 
 
 
379 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.66 
 
 
386 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.67 
 
 
388 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.78 
 
 
386 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.99 
 
 
392 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.57 
 
 
392 aa  160  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.03 
 
 
384 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.91 
 
 
387 aa  159  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0654  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.99 
 
 
393 aa  159  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.308517 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3164  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.63 
 
 
389 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.768074  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.03 
 
 
382 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04879  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.63 
 
 
389 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.640254  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0967  succinyl-CoA synthase, beta subunit  34.73 
 
 
386 aa  158  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.91 
 
 
397 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.91 
 
 
397 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2240  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.06 
 
 
391 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.014872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.25 
 
 
387 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.16 
 
 
397 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.27 
 
 
382 aa  157  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1557  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.31 
 
 
390 aa  157  4e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  31.63 
 
 
400 aa  157  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.813583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7987  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.65 
 
 
392 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.31 
 
 
387 aa  157  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.06 
 
 
390 aa  157  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.93 
 
 
386 aa  156  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.31 
 
 
387 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1562  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.81 
 
 
362 aa  155  9e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.99 
 
 
382 aa  155  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.2 
 
 
389 aa  155  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  31.31 
 
 
391 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.73 
 
 
392 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.25 
 
 
397 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28160  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  31.96 
 
 
390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6508  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.93 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  31.04 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0043  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  34.21 
 
 
360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0821  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.33 
 
 
397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2537  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  31.46 
 
 
393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.48 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1243  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  32.82 
 
 
393 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766366  hitchhiker  0.00547287 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.65 
 
 
388 aa  153  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.65 
 
 
388 aa  153  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.89 
 
 
388 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.5 
 
 
385 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  31.89 
 
 
388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.95 
 
 
388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.93 
 
 
386 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
388 aa  152  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.57 
 
 
391 aa  152  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.130475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0247  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  31.02 
 
 
388 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1079  malate--CoA ligase subunit beta  29.23 
 
 
396 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00492419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.67 
 
 
386 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.09 
 
 
410 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3999  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.97 
 
 
411 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00455857  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.91 
 
 
381 aa  152  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.42 
 
 
386 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.42 
 
 
386 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.42 
 
 
386 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.42 
 
 
386 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.42 
 
 
386 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.42 
 
 
386 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.42 
 
 
386 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0479  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  32.56 
 
 
362 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.42 
 
 
386 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.69 
 
 
388 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.16 
 
 
386 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3017  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.08 
 
 
395 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0271447  normal  0.0121594 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.82 
 
 
390 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.95 
 
 
382 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3724  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.65 
 
 
392 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637154  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0357  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.03 
 
 
362 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0021079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.25 
 
 
385 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0397  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  31.03 
 
 
417 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.254112  normal  0.0232854 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1988  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  30.2 
 
 
401 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.76 
 
 
379 aa  151  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09090  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.82 
 
 
389 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4207  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  29.69 
 
 
384 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.184517  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4233  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.43 
 
 
393 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.510138  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  31.59 
 
 
382 aa  150  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43950  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.43 
 
 
388 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0993593  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>