161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3327 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 227 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  83.7 
 
 		 232 aa  397  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  74.45 
 
 		 228 aa  367  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  67.11 
 
 		 232 aa  323  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  64.32 
 
 		 230 aa  320  8e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  64.76 
 
 		 230 aa  315  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  65.64 
 
 		 228 aa  314  6e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  60.79 
 
 		 227 aa  313  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  63.16 
 
 		 231 aa  311  6.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  62.83 
 
 		 227 aa  308  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  62.11 
 
 		 234 aa  305  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  62.11 
 
 		 240 aa  304  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  62.83 
 
 		 238 aa  300  9e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  60.79 
 
 		 234 aa  297  8e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  58.59 
 
 		 232 aa  290  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  55.07 
 
 		 259 aa  275  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  54.19 
 
 		 230 aa  272  4.0000000000000004e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  45.13 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  46.7 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  43.3 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  43.3 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  43.3 
 
 		 232 aa  208  7e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  46.26 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  43.36 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  42.11 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  37.89 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  37 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  35.68 
 
 		 234 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  37 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  38.6 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  34.78 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  38.33 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  32.02 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  28.8 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  29.14 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  29.14 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  29.44 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1933  hydrogenase nickel incorporation protein  28.42 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  28.41 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  27.13 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  29.73 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  29.14 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  26.29 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2165  hydrogenase accessory protein HypB  30.34 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  29.84 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  27.59 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  29 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1205  urease accessory protein UreG  30.46 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2753  urease accessory protein UreG  31.82 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0806758  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  29.71 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  28.76 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  25.56 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  26.88 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4413  urease accessory protein UreG  32.19 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1082  urease accessory protein UreG  30.05 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3559  urease accessory protein  30.05 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29571  normal  0.0153059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1136  urease accessory protein UreG  30.05 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  28.88 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  28.57 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1756  urease accessory protein UreG  28.24 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0086861  normal  0.860103 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  26.82 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  26.6 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  28.88 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3302  urease accessory protein UreG  32.89 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  26.7 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3046  urease accessory protein UreG  32.89 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.317226  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  27.08 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  29.12 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0748  urease accessory protein UreG  32.65 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  29.32 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1946  urease accessory protein UreG  30.46 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00965207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  27.6 
 
 		 246 aa  48.9  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  26.37 
 
 		 224 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  28.02 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  27 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  29.95 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3468  urease accessory protein UreG  32.48 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6443  urease accessory protein UreG  29.41 
 
 		 226 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187428  normal  0.14632 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1263  urease accessory protein  30 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1464  urease accessory protein UreG  28.14 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0302  urease accessory protein G  30.46 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  27.86 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  28.57 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1938  hydrogenase accessory protein HypB  28.41 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  26.63 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1684  urease accessory protein UreG  30.32 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1302  urease accessory protein UreG  28.14 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17110  hydrogenase accessory protein HypB  26.67 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03880  hydrogenase accessory protein HypB  23.53 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  29.51 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1244  urease accessory protein UreG  27.47 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2213  cobalamin synthesis protein, P47K  28.49 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.686055  normal  0.309193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2063  urease accessory protein UreG  27.09 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000301925  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0992  urease accessory protein UreG  29.8 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  25.14 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1556  urease accessory protein UreG  26.58 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  24.61 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  28.79 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  29.12 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2847  urease accessory protein UreG  30.72 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>