More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5091 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  100 
 
 		 223 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  53.43 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  52.88 
 
 		 227 aa  198  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  53.49 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  54.77 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  54.77 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  54.19 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  56.85 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  53.77 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  53.49 
 
 		 306 aa  178  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  52.63 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  53.42 
 
 		 242 aa  175  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  46.67 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  51.13 
 
 		 245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  50.24 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  51.13 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  54.64 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  51.36 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  47.44 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  53.26 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  49.05 
 
 		 236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  53.52 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  50.25 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  54.3 
 
 		 241 aa  158  8e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  48.84 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  48.85 
 
 		 241 aa  155  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  48.17 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  55.62 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  48.6 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  54.44 
 
 		 222 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  50.93 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  43.41 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  44.24 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  59.24 
 
 		 236 aa  131  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  39.71 
 
 		 255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  47.59 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  45.32 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  42.16 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  43.51 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  43.17 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  35.59 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  37.41 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  42.14 
 
 		 208 aa  95.1  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  40.62 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  38.61 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  39.1 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  39.78 
 
 		 209 aa  92  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  38.61 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  38.61 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  35.29 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  37.57 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  37.57 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  37.57 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  37.57 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  37.57 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  37.57 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  37.57 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  36.31 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  30.12 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  38.41 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  31.94 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  39.29 
 
 		 236 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  37.82 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  35.22 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  33.51 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  35.37 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  35.37 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  35.48 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  35.48 
 
 		 207 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  35.48 
 
 		 207 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  35.48 
 
 		 207 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  28.04 
 
 		 239 aa  85.1  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  38.06 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  35.63 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1749  16S rRNA methyltransferase GidB  29.53 
 
 		 209 aa  85.1  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  33.76 
 
 		 216 aa  85.1  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  35.48 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  42.38 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  25.84 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  42.38 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  32.88 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  31.25 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  35.03 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  32.65 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  33.13 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  37.12 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  36.88 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  37.12 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  39.35 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3855  16S rRNA methyltransferase GidB  32.08 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  41.22 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  30.94 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  30.98 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  32.28 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  31.89 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  37.74 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  30.82 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  34.55 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  28.66 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>