220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2207 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2207  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 367 aa  711    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  51 
 
 		 1079 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  49.29 
 
 		 1080 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3903  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.66 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3977  alcohol dehydrogenase  55.66 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3918  alcohol dehydrogenase  55.35 
 
 		 364 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0508514  normal  0.13428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.28 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2316  alcohol dehydrogenase  32.45 
 
 		 334 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2745  putative dehydrogenase  34.62 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000542225  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1296  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.22 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1999  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.15 
 
 		 336 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0767  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3514  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.12 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.17 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1527  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.32 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3598  putative dehydrogenase  31.99 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927271  hitchhiker  0.00450633 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0522  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.27 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0876145  normal  0.61344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.17 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1678  putative dehydrogenase  28.09 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0642  dehydrogenase  27.76 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38005  predicted protein  24 
 
 		 1005 aa  66.2  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0315  putative dehydrogenase  31.38 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2606  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.48 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000263757 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0795  dehydrogenase  26.69 
 
 		 340 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1178  putative dehydrogenase  27.59 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2412  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.13 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0431733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2588  alcohol dehydrogenase  24.13 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1679  dehydrogenase  29.05 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  29.24 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.22 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1306  alcohol dehydrogenase  30.81 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2642  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.1 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1737  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.52 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2331  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.8 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2561  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.42 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0898  chlorophyll synthesis pathway, BchC  26.69 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.714457  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1548  alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0106468  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1534  chlorophyll synthesis pathway, BchC  27.71 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910743 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1422  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  29.72 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  29.07 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0980  chlorophyll synthesis pathway, BchC  28.74 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0401  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  30.28 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.632471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1809  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.07 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  26.62 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.13 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2083  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.94 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.6772  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1791  chlorophyll synthesis pathway, BchC  28.35 
 
 		 334 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.916125  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0108  alcohol dehydrogenase  37.32 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.476377  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01290  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  25.07 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2333  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.07 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.541435  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01301  hypothetical protein  25.07 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1523  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.07 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0938  chlorophyll synthesis pathway, BchC  27.56 
 
 		 325 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2312  alcohol dehydrogenase  25.07 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1428  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.07 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.97 
 
 		 373 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.434256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.46 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  38.24 
 
 		 343 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1958  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.14 
 
 		 350 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.5 
 
 		 347 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 352 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.61 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2751  hypothetical protein  36.04 
 
 		 326 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2604  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  23.74 
 
 		 308 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000105247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4353  alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.07 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.81 
 
 		 336 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  32.74 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.5 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.66 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  32.43 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1078  putative dehydrogenase  21.65 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.77 
 
 		 356 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02580  sorbitol dehydrogenase, putative  30.06 
 
 		 416 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  29.65 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1611  chlorophyll synthesis pathway, BchC  31.91 
 
 		 327 aa  50.8  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7649  zinc-binding dehydrogenase  33.33 
 
 		 357 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.3 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 		 365 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1615  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.51 
 
 		 368 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0192054 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2765  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family superfamily  28.42 
 
 		 213 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000378311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.69 
 
 		 354 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8852  L-threonine 3-dehydrogenase  28.32 
 
 		 342 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  34.31 
 
 		 343 aa  49.7  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2512  alcohol dehydrogenase  38.61 
 
 		 346 aa  49.7  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.881464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2161  alcohol dehydrogenase  24.68 
 
 		 350 aa  49.7  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.270526 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0293  L-threonine 3-dehydrogenase  29.48 
 
 		 347 aa  49.7  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2453  putative dehydrogenase  24.36 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.33 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2367  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25 
 
 		 179 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336249  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2217  alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.26 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.59 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74116  Sorbitol dehydrogenase  26.98 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0885  alcohol dehydrogenase  28.91 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>