138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1271 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 327 aa  631  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  37.65 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.82 
 
 		 346 aa  205  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.25 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 		 345 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.31 
 
 		 341 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  36.11 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  39.22 
 
 		 331 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  35.8 
 
 		 340 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  34.48 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  34.2 
 
 		 340 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  35.8 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  34.2 
 
 		 340 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  42.62 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  36.11 
 
 		 345 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  43.79 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.45 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.59 
 
 		 352 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.41 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.25 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.65 
 
 		 344 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  39.45 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.62 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.71 
 
 		 324 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.38 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.21 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 		 342 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.31 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  33.58 
 
 		 324 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.53 
 
 		 338 aa  105  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  29.58 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  28.45 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  26.62 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  28.03 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  28.03 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  26.07 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  25.74 
 
 		 290 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  25.08 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  26.42 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  24.38 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  23.05 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  26.86 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  30.16 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  29.29 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0848085  normal  0.577467 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  25.42 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.35 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.35 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  28.29 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  28.03 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  30.71 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  28.05 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  26.99 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  25.59 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  24.62 
 
 		 329 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 		 342 aa  52.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  24.62 
 
 		 329 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.77 
 
 		 328 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  25.68 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1819  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000110086  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.98 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 		 368 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 680 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.8 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  26.9 
 
 		 694 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.85 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  26 
 
 		 327 aa  45.8  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  25.15 
 
 		 329 aa  45.8  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  25.76 
 
 		 342 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>