More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3236 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  100 
 
 		 252 aa  500  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  62.55 
 
 		 258 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  57.94 
 
 		 253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  55.16 
 
 		 259 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  54.37 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  50.4 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3606  TatD family hydrolase  53.39 
 
 		 269 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000130951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  44.84 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  42.86 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  43.25 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  43.65 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  44.05 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  44.05 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  44.05 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  44.05 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  42.69 
 
 		 257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  44.05 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  44.05 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  44.05 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  43.65 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  43.65 
 
 		 255 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  41.57 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  41.18 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  43.97 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  41.18 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  41.34 
 
 		 257 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  42.29 
 
 		 606 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  44.22 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  41.5 
 
 		 462 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  39.76 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  40.16 
 
 		 464 aa  192  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  39.37 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  40.39 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  40.32 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  44.36 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  40.87 
 
 		 458 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  43.97 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  38.04 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  38.98 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  39.13 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  43.97 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  35.43 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  36.25 
 
 		 260 aa  185  5e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  36.76 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  38.82 
 
 		 462 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  41.18 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  40.87 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  37.3 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  43.25 
 
 		 263 aa  181  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  38.34 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  35.27 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  36.05 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  40.08 
 
 		 457 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  38.04 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  40.23 
 
 		 275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  39.92 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  35.83 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  38.74 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  39.29 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  39.29 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  35.43 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  40.08 
 
 		 458 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  41.34 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  37.05 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  41.8 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  37.55 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  40.71 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  39.13 
 
 		 265 aa  175  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  40 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  35.8 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3015  TatD family deoxyribonuclease  40.78 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.91144e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  39.61 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  41.9 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  37.94 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  37.5 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  41.03 
 
 		 261 aa  171  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  38.19 
 
 		 268 aa  171  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  35.25 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  40.08 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  40.08 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  40.08 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  33.73 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  38.74 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  35.18 
 
 		 258 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  35.66 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  38.98 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  37.75 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1227  hydrolase, TatD family  35.43 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  39.77 
 
 		 263 aa  169  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  36.08 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  37.65 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  40.71 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  36.08 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  37.35 
 
 		 264 aa  168  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  36.86 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  34.73 
 
 		 267 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  38.74 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  34.39 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  36.61 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  38.19 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>