More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2131 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
480 aa  980    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.42 
 
 
480 aa  538  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  44.91 
 
 
483 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  45.97 
 
 
479 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
496 aa  414  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  43.82 
 
 
496 aa  412  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.26 
 
 
497 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.65 
 
 
491 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  41.21 
 
 
486 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  42.03 
 
 
481 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  41.2 
 
 
482 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  41.75 
 
 
498 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  41.6 
 
 
489 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  42.64 
 
 
510 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  42.47 
 
 
481 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  41.83 
 
 
489 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
490 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  43.27 
 
 
482 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  42.26 
 
 
481 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 
510 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  40.87 
 
 
483 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  42.56 
 
 
485 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  42.32 
 
 
482 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  42.98 
 
 
484 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  40.12 
 
 
483 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  39.51 
 
 
486 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
489 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  41.82 
 
 
482 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  40.99 
 
 
483 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  40.95 
 
 
500 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  41.54 
 
 
488 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  41.41 
 
 
482 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  42.33 
 
 
466 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  41.3 
 
 
491 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  42.89 
 
 
490 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.11 
 
 
483 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.88 
 
 
489 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  44.09 
 
 
492 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  43.88 
 
 
489 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.54 
 
 
483 aa  359  6e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.9 
 
 
483 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.9 
 
 
483 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.9 
 
 
483 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  40.42 
 
 
483 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.9 
 
 
483 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  43.31 
 
 
489 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.69 
 
 
483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.69 
 
 
483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.69 
 
 
483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  42.86 
 
 
479 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  43.49 
 
 
489 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  39.46 
 
 
490 aa  356  5e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05194  putative benzaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  42.98 
 
 
492 aa  355  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0026447  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.48 
 
 
483 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  39.62 
 
 
493 aa  355  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  41.41 
 
 
483 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2977  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  43.59 
 
 
491 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  40.89 
 
 
477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  43.09 
 
 
482 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  40.58 
 
 
483 aa  353  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.11 
 
 
483 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  41.04 
 
 
510 aa  352  8e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  43.06 
 
 
482 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  41.84 
 
 
483 aa  350  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.46 
 
 
486 aa  350  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  40.35 
 
 
464 aa  349  6e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3357  vanillin dehydrogenase  40.99 
 
 
482 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829356  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  39.57 
 
 
482 aa  348  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  39.57 
 
 
482 aa  348  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.57 
 
 
482 aa  348  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.25 
 
 
484 aa  347  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.57 
 
 
482 aa  348  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  44.51 
 
 
492 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
480 aa  347  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  40.59 
 
 
473 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.36 
 
 
482 aa  346  7e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2401  aldehyde dehydrogenase  40.79 
 
 
482 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.15 
 
 
482 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.36 
 
 
482 aa  345  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.36 
 
 
482 aa  345  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
498 aa  344  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0051  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
482 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0422241  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
483 aa  344  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4915  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
482 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  42.02 
 
 
488 aa  344  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 
510 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.25 
 
 
496 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4594  aldehyde dehydrogenase  42.24 
 
 
482 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  38.87 
 
 
497 aa  342  5.999999999999999e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2734  aldehyde dehydrogenase  41.08 
 
 
493 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350439 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  38.66 
 
 
503 aa  342  9e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.46 
 
 
493 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.48 
 
 
493 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.82 
 
 
480 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.61 
 
 
480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  42.39 
 
 
486 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  40 
 
 
493 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.61 
 
 
480 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.61 
 
 
480 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.79 
 
 
487 aa  339  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>