37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1200 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  38.16 
 
 		 1805 aa  988    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  31.39 
 
 		 1921 aa  728    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  100 
 
 		 2159 aa  4370    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1230  hypothetical protein  33.37 
 
 		 1831 aa  720    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  36.43 
 
 		 1878 aa  860    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  34.2 
 
 		 1460 aa  689    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  33.29 
 
 		 1937 aa  588  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.485173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3192  hypothetical protein  33.04 
 
 		 933 aa  352  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00191616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3056  PGAP1 family protein  27.6 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2528  hypothetical protein  28.89 
 
 		 459 aa  74.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1268 aa  71.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  26.15 
 
 		 532 aa  62.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4676  hypothetical protein  24.41 
 
 		 471 aa  60.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4965  hypothetical protein  30.3 
 
 		 457 aa  58.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 1429 aa  57.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 916 aa  55.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1130  hypothetical protein  23.9 
 
 		 468 aa  55.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00209773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3524  prophage LambdaBa01, acyltransferase  22.13 
 
 		 876 aa  52  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3805  prophage LambdaBa01, acyltransferase  22.13 
 
 		 876 aa  52  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  27.81 
 
 		 1914 aa  52  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 1714 aa  51.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1019  hypothetical protein  23.49 
 
 		 659 aa  51.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.172565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1142 aa  50.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6700  hypothetical protein  31.17 
 
 		 306 aa  50.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0587904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1096 aa  50.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  24.76 
 
 		 447 aa  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1238 aa  49.7  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  35.82 
 
 		 589 aa  48.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 1285 aa  48.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.75 
 
 		 2741 aa  47.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  24.08 
 
 		 467 aa  47  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3055  hypothetical protein  30 
 
 		 615 aa  46.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1051 aa  46.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  25.8 
 
 		 883 aa  46.2  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  23.79 
 
 		 1007 aa  46.2  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  29.7 
 
 		 989 aa  45.8  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3350  GUN4-like  26.28 
 
 		 979 aa  45.8  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>