160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3821 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  100 
 
 		 404 aa  772    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  59.86 
 
 		 394 aa  310  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  58.8 
 
 		 391 aa  292  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  47.08 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  47.08 
 
 		 366 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  37 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  33.9 
 
 		 373 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  36.49 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  38.66 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  39.16 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  37.58 
 
 		 390 aa  149  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  34.39 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  35.52 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  35.17 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  34.81 
 
 		 361 aa  143  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  33.96 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  34.49 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  35.79 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  36.04 
 
 		 376 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  36.88 
 
 		 391 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  34.63 
 
 		 465 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  36.63 
 
 		 376 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  34.6 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  34.6 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  36.52 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  34.6 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  35.89 
 
 		 391 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  34.53 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  34.53 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  35.46 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  35.49 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  34.75 
 
 		 378 aa  136  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  40.95 
 
 		 374 aa  136  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  34.84 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  33.1 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  32.74 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 		 384 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  32.16 
 
 		 379 aa  133  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  32.16 
 
 		 379 aa  133  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 		 384 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  34.86 
 
 		 379 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  34.67 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  34.98 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  34.88 
 
 		 346 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  38.11 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  35.92 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  35.19 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  35.19 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  34.68 
 
 		 373 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  32.99 
 
 		 410 aa  122  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  32.97 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  32.97 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  35.87 
 
 		 323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  38.14 
 
 		 238 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  35.04 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  34.72 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  33.18 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  36.05 
 
 		 383 aa  103  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4734  CBS domain-containing protein  36.4 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  30.93 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  34.2 
 
 		 301 aa  97.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 		 449 aa  96.3  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  37.3 
 
 		 285 aa  94.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  36.54 
 
 		 199 aa  94.4  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  37.74 
 
 		 194 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  26.23 
 
 		 325 aa  90.1  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  35.67 
 
 		 180 aa  90.1  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  28.18 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  42.14 
 
 		 157 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  39.34 
 
 		 180 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  38.86 
 
 		 178 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  30.77 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  37.09 
 
 		 183 aa  86.7  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  38.85 
 
 		 181 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  32.97 
 
 		 231 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  39.63 
 
 		 179 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  35.19 
 
 		 199 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  37.78 
 
 		 182 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  37.78 
 
 		 182 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  36.72 
 
 		 175 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  30.42 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  37.5 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  37.5 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  38.55 
 
 		 284 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  37.36 
 
 		 207 aa  82.8  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  37.5 
 
 		 182 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  36.76 
 
 		 182 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  37.5 
 
 		 182 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  36.76 
 
 		 182 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  37.8 
 
 		 190 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  38.99 
 
 		 178 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2860  HPP  32.08 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  34.18 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  47.87 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  34.65 
 
 		 231 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  39.29 
 
 		 207 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  35.76 
 
 		 152 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  38.1 
 
 		 164 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>