More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2105 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 274 aa  537  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  78.83 
 
 		 274 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  78.83 
 
 		 274 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  78.83 
 
 		 274 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  77.74 
 
 		 271 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  74.36 
 
 		 274 aa  388  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  72.73 
 
 		 272 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  77.01 
 
 		 271 aa  384  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  75.55 
 
 		 271 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  67.52 
 
 		 271 aa  358  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  68.63 
 
 		 274 aa  346  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  62.04 
 
 		 271 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  62.91 
 
 		 275 aa  328  8e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  62.18 
 
 		 275 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  60.5 
 
 		 278 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  64.1 
 
 		 270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  58.36 
 
 		 278 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  57.14 
 
 		 270 aa  302  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  58.72 
 
 		 278 aa  301  8.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  57.91 
 
 		 276 aa  285  5e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  54.68 
 
 		 276 aa  276  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  53.21 
 
 		 282 aa  265  5.999999999999999e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  51.77 
 
 		 279 aa  261  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  51.42 
 
 		 274 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  50 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  51.26 
 
 		 275 aa  259  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  54.93 
 
 		 281 aa  258  6e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  50.36 
 
 		 277 aa  255  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  51.44 
 
 		 278 aa  254  8e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  51.25 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  53.71 
 
 		 281 aa  251  8.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  52.16 
 
 		 278 aa  251  9.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  51.8 
 
 		 278 aa  248  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  48.75 
 
 		 279 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  42.91 
 
 		 283 aa  212  3.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  45.04 
 
 		 283 aa  210  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  44.44 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  44.8 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  40.79 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  44.8 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  44.8 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  44.8 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  44.8 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  44.8 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  44.8 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  44.8 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  43.37 
 
 		 293 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  45.09 
 
 		 291 aa  198  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  43.48 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  43.64 
 
 		 288 aa  196  5.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  39.72 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  39.36 
 
 		 292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  39.07 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 292 aa  188  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  41.94 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  41.94 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  41.94 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  41.73 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  41.58 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  41.58 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  41.58 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  42.81 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  42.45 
 
 		 283 aa  185  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  43.17 
 
 		 283 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  43.17 
 
 		 283 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  41.22 
 
 		 293 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  43.17 
 
 		 283 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  43.17 
 
 		 283 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  40 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  42.45 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  46.15 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  41.43 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  42.65 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.07 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  42.35 
 
 		 291 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  41.18 
 
 		 308 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  39.25 
 
 		 288 aa  181  9.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1140  elongation factor Ts  44.16 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000133846  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  39.46 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  41.22 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  41.58 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  40.97 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  42.34 
 
 		 282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  39.79 
 
 		 308 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>