More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1790 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1790  amidohydrolase  100 
 
 		 392 aa  771    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1612  amidohydrolase  62.63 
 
 		 391 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0986  amidohydrolase  65.45 
 
 		 393 aa  475  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4826  amidohydrolase  64.97 
 
 		 391 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13334  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase amiA1  63.42 
 
 		 389 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1273  amidohydrolase  64.97 
 
 		 390 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1263  amidohydrolase  64.44 
 
 		 390 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.413337 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1246  peptidase M20D, amidohydrolase  64.44 
 
 		 390 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6414  amidohydrolase  61.33 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.820069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05720  amidohydrolase  63.3 
 
 		 426 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1358  amidohydrolase  52.14 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.624162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  50.76 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4199  amidohydrolase  51.41 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0777  amidohydrolase  53.7 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.121593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0833  amidohydrolase  53.44 
 
 		 480 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.0130422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2948  amidohydrolase  53.66 
 
 		 415 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413179 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0675  amidohydrolase  50.51 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.925294  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2564  peptidase M20D, amidohydrolase  51.41 
 
 		 410 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0781  amidohydrolase  52.69 
 
 		 418 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3950  amidohydrolase  53.14 
 
 		 415 aa  364  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0776  amidohydrolase  51.32 
 
 		 391 aa  363  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0823  amidohydrolase  50.65 
 
 		 399 aa  363  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25770  amidohydrolase  50.77 
 
 		 401 aa  363  4e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.336885  normal  0.797588 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0993  amidohydrolase  52.37 
 
 		 421 aa  362  4e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.491415  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4375  amidohydrolase  51.47 
 
 		 415 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5928  amidohydrolase  51.72 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1206  amidohydrolase  51.33 
 
 		 399 aa  356  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000127649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1268  Aminoacylase  49.62 
 
 		 412 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0694  peptidase M20D, amidohydrolase  51.84 
 
 		 414 aa  350  3e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.887373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3542  amidohydrolase  51.76 
 
 		 406 aa  345  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0576858  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1133  amidohydrolase  50.27 
 
 		 399 aa  338  7e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1019  amidohydrolase  49.06 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.533983 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21290  amidohydrolase  49.73 
 
 		 413 aa  333  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04870  amidohydrolase  46.56 
 
 		 418 aa  311  1e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.946218  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  38.7 
 
 		 386 aa  263  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  38.86 
 
 		 394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  38.08 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  37.82 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  37.23 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  40.27 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  36.97 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  41.03 
 
 		 395 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  40.16 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  40.73 
 
 		 392 aa  243  5e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  41.03 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  41.03 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  40.7 
 
 		 395 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  38.92 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  39.57 
 
 		 389 aa  236  7e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  39.84 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  41.53 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  40.62 
 
 		 393 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  36.44 
 
 		 381 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  38.86 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  39.02 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  36.17 
 
 		 381 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  36.03 
 
 		 381 aa  229  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  39.31 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  38.87 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  38.48 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  35.36 
 
 		 386 aa  226  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  35.16 
 
 		 403 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.56 
 
 		 381 aa  226  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  40.21 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  35.92 
 
 		 388 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  36.46 
 
 		 387 aa  223  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  37.53 
 
 		 425 aa  222  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  35.35 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  38.11 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  34.29 
 
 		 391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  38.81 
 
 		 396 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  35.6 
 
 		 387 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  34.03 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  37.17 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  33.07 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  35.23 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  35.23 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  36.41 
 
 		 405 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  39.84 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.68 
 
 		 389 aa  215  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  36.8 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  37.97 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  38.83 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  38.42 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.29 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  36.39 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.83 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  36 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  35.5 
 
 		 380 aa  212  7e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  39.13 
 
 		 390 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  38.75 
 
 		 391 aa  212  7.999999999999999e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  36.27 
 
 		 409 aa  212  9e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  38.07 
 
 		 396 aa  212  9e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.9 
 
 		 391 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.9 
 
 		 391 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  36.19 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  39.62 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  36.31 
 
 		 405 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  32.79 
 
 		 390 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  35.15 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>