More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0950 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0950  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 431 aa  875    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2501  recombination factor protein RarA  75.81 
 
 		 430 aa  667    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  58.19 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  58.33 
 
 		 428 aa  488  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  57.86 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  58.33 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  57.62 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  58.33 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  57.86 
 
 		 428 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  58.1 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  58.1 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  57.86 
 
 		 428 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  57.62 
 
 		 428 aa  484  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  52.36 
 
 		 424 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  52.36 
 
 		 424 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1190  recombination factor protein RarA  51.77 
 
 		 423 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1846  recombination factor protein RarA  51.76 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  51.42 
 
 		 434 aa  431  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1228  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 422 aa  394  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  47.66 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  48.71 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  47.67 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  48.23 
 
 		 422 aa  381  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  45.24 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  48.24 
 
 		 441 aa  365  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  47.54 
 
 		 436 aa  363  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  46.63 
 
 		 437 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  47.33 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  47.69 
 
 		 441 aa  356  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  47.18 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  45.02 
 
 		 444 aa  353  4e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  43.85 
 
 		 431 aa  353  5e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  46.36 
 
 		 438 aa  349  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  42.28 
 
 		 447 aa  347  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  47.36 
 
 		 500 aa  347  3e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  45.75 
 
 		 456 aa  346  4e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  45.08 
 
 		 432 aa  346  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  42.89 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  45.08 
 
 		 432 aa  345  6e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  44.05 
 
 		 519 aa  345  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  42.86 
 
 		 446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  46.12 
 
 		 447 aa  342  8e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  42.38 
 
 		 432 aa  342  9e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  45.56 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  45.52 
 
 		 436 aa  340  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.5 
 
 		 731 aa  339  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  44.36 
 
 		 423 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  44.26 
 
 		 739 aa  338  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  45.54 
 
 		 461 aa  338  9e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  44.13 
 
 		 443 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1757  recombination factor protein RarA  44.01 
 
 		 415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  42.72 
 
 		 435 aa  336  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  45.87 
 
 		 458 aa  334  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  46.15 
 
 		 457 aa  334  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  47.57 
 
 		 425 aa  332  7.000000000000001e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  45.03 
 
 		 448 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  44.88 
 
 		 465 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1356  AAA ATPase central domain protein  43.18 
 
 		 464 aa  328  9e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.873359 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  47.26 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  43.78 
 
 		 465 aa  327  2.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  42.73 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  44.03 
 
 		 456 aa  326  4.0000000000000003e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  42.35 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  41.98 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  44.01 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.99 
 
 		 721 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  43.69 
 
 		 456 aa  323  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  42.22 
 
 		 435 aa  323  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  42.86 
 
 		 473 aa  322  7e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  42.79 
 
 		 439 aa  322  8e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  43.87 
 
 		 422 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  45.56 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  42.89 
 
 		 441 aa  322  9.999999999999999e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  43.52 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  43.45 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  44.03 
 
 		 452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  42.08 
 
 		 435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.74 
 
 		 733 aa  320  3e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  44.12 
 
 		 735 aa  319  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  43.48 
 
 		 484 aa  319  7e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  45.41 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  42.72 
 
 		 434 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  42.49 
 
 		 434 aa  316  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  42.99 
 
 		 445 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl403  recombination factor protein RarA  40.8 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  42.12 
 
 		 453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2283  recombination factor protein RarA  42.66 
 
 		 474 aa  312  6.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243633  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0515  recombination factor protein RarA  38.95 
 
 		 412 aa  310  2e-83  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  42.82 
 
 		 447 aa  310  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  43.52 
 
 		 456 aa  310  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  39.86 
 
 		 446 aa  310  5e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2019  recombination factor protein RarA  43.84 
 
 		 466 aa  309  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000217538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1685  AAA ATPase central domain protein  41.46 
 
 		 478 aa  309  8e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  41.98 
 
 		 447 aa  308  9e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17650  Recombination protein MgsA  41.24 
 
 		 490 aa  308  9e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.397333  normal  0.0704378 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  43.26 
 
 		 440 aa  308  9e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>