More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1998 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 423 aa  850    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  67.07 
 
 		 421 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  29.43 
 
 		 424 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  29.14 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  27.92 
 
 		 423 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 424 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  27.88 
 
 		 418 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  27.88 
 
 		 418 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  28.05 
 
 		 423 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  27.71 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 423 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 423 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  27.82 
 
 		 423 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 423 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  27.35 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  27.89 
 
 		 418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  28.07 
 
 		 418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  27.36 
 
 		 423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  28.07 
 
 		 418 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  27.13 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  26.96 
 
 		 423 aa  170  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 424 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  26.94 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2097  transporter, putative  28.24 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  25.7 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2466  major facilitator superfamily permease  25.67 
 
 		 406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0163  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  24.71 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  26.1 
 
 		 407 aa  106  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  24.72 
 
 		 423 aa  106  9e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  24.27 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  24.11 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0168  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 416 aa  100  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0163  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 416 aa  100  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  25.07 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  26.84 
 
 		 405 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  24.67 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  25.3 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  25.24 
 
 		 412 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  25.12 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  24.82 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2339  drug transporter, putative  22.34 
 
 		 413 aa  93.6  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  22.93 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 412 aa  90.5  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 419 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 450 aa  82.8  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  24.89 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  21.79 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  23.66 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  21.88 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  21.43 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  21.43 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  21.43 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  21.43 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  21.43 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  21.43 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  21.43 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  21.43 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  23.56 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  21.43 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  21.15 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  22.22 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  21.15 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  22.22 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  20.45 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  21.15 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  22.22 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  21.15 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  21.15 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  22.94 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  23.76 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>