More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0145 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0145  recombinase A  100 
 
 		 338 aa  677    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  91.12 
 
 		 339 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  88.05 
 
 		 338 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  87.5 
 
 		 338 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  89.12 
 
 		 333 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  85.76 
 
 		 336 aa  567  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  86.77 
 
 		 340 aa  558  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  81.1 
 
 		 341 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  78.42 
 
 		 358 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  76.6 
 
 		 358 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  76.29 
 
 		 358 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  76.6 
 
 		 358 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  74.17 
 
 		 379 aa  511  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  71.78 
 
 		 358 aa  494  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  70.12 
 
 		 343 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  71.73 
 
 		 358 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  71.95 
 
 		 366 aa  488  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  71.43 
 
 		 358 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  68.66 
 
 		 378 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  71.78 
 
 		 355 aa  488  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  71.17 
 
 		 361 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  72.36 
 
 		 341 aa  485  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  70.59 
 
 		 348 aa  484  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  70.59 
 
 		 348 aa  484  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  70.43 
 
 		 362 aa  484  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  70.83 
 
 		 342 aa  486  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  70.25 
 
 		 359 aa  484  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  71.88 
 
 		 348 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  73.82 
 
 		 347 aa  487  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  72.5 
 
 		 360 aa  484  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  71.12 
 
 		 358 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  68.05 
 
 		 352 aa  484  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  68.05 
 
 		 352 aa  485  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  69.62 
 
 		 345 aa  481  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  70.87 
 
 		 343 aa  482  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  70.86 
 
 		 424 aa  483  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  71.12 
 
 		 364 aa  484  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  70.86 
 
 		 361 aa  482  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  68.82 
 
 		 356 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  68.82 
 
 		 356 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  68.82 
 
 		 356 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  69.62 
 
 		 345 aa  481  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  68.82 
 
 		 356 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  70.86 
 
 		 361 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  71.83 
 
 		 343 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  72.09 
 
 		 362 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  69.86 
 
 		 365 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  71.17 
 
 		 345 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  68.82 
 
 		 356 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  68.82 
 
 		 356 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  70.25 
 
 		 347 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  68.66 
 
 		 345 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  70.87 
 
 		 343 aa  482  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  70.52 
 
 		 361 aa  481  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  71.56 
 
 		 368 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  68.82 
 
 		 356 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  70.25 
 
 		 350 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  73.12 
 
 		 358 aa  483  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  70.91 
 
 		 384 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  70.52 
 
 		 345 aa  481  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  71.78 
 
 		 364 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  70.52 
 
 		 357 aa  481  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  66.06 
 
 		 347 aa  478  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  73.8 
 
 		 347 aa  480  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  75.16 
 
 		 346 aa  478  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  69.91 
 
 		 356 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  69.33 
 
 		 350 aa  478  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  69.6 
 
 		 364 aa  478  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  69.91 
 
 		 348 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  68.82 
 
 		 356 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  72.5 
 
 		 356 aa  478  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  69.82 
 
 		 363 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  69.6 
 
 		 359 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  70.25 
 
 		 343 aa  478  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  69.91 
 
 		 356 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  70.43 
 
 		 350 aa  478  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  69.6 
 
 		 359 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  69.91 
 
 		 356 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  69.33 
 
 		 347 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  69.94 
 
 		 376 aa  478  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1287  recombinase A  71.94 
 
 		 343 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.569427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  70.19 
 
 		 348 aa  478  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  70.62 
 
 		 357 aa  474  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  68.69 
 
 		 363 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  69.82 
 
 		 362 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  70.31 
 
 		 347 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  69.7 
 
 		 366 aa  474  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  69.51 
 
 		 362 aa  474  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  71.47 
 
 		 347 aa  474  1e-133  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  69.63 
 
 		 352 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  72.38 
 
 		 377 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  69.21 
 
 		 363 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  69.94 
 
 		 360 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  70.19 
 
 		 348 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  69.33 
 
 		 350 aa  477  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  68.4 
 
 		 367 aa  476  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  68.42 
 
 		 390 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  70.31 
 
 		 347 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  69.33 
 
 		 350 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  69.51 
 
 		 363 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>