39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2678 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2678  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  339  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000820261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2344  hypothetical protein  49.07 
 
 		 164 aa  158  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1537  hypothetical protein  34.36 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2674  hypothetical protein  34.52 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000300663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1541  hypothetical protein  33.73 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1805  hypothetical protein  34.38 
 
 		 159 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0988  hypothetical protein  31.45 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2154  hypothetical protein  36.02 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2037  hypothetical protein  30.82 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0651  methylation site containing protein  26.47 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  36.51 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  34.15 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2552  hypothetical protein  34.52 
 
 		 185 aa  47.4  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  28.41 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  32.76 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  32.43 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  36.23 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1044  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  44.7  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  25 
 
 		 182 aa  44.3  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  29.27 
 
 		 201 aa  44.7  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  33.87 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  27.17 
 
 		 168 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  30.93 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.33 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.62 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  38.98 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1122  hypothetical protein  31.82 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.711782  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  33.93 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  34.57 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1056  hypothetical protein  37.1 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  34.33 
 
 		 199 aa  42  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  35.21 
 
 		 144 aa  42  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.92 
 
 		 192 aa  42  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  35.53 
 
 		 212 aa  41.6  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  41.67 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  31.75 
 
 		 168 aa  40.8  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.93 
 
 		 187 aa  40.8  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  33.8 
 
 		 144 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  37.93 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>