233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0915 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0915  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 307 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.92605e-32 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  41.97 
 
 		 322 aa  248  9e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  41.45 
 
 		 321 aa  245  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  45 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  45 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  45 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  39.93 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  39.68 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  39.14 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  43.48 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  40.67 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  44.15 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  39.46 
 
 		 311 aa  235  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  45.22 
 
 		 329 aa  235  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  42 
 
 		 312 aa  235  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  39.27 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  41.59 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  38.89 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  41.75 
 
 		 308 aa  232  6e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  43.33 
 
 		 335 aa  232  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  43.73 
 
 		 314 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  43.23 
 
 		 318 aa  231  9e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  42.67 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  43 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  39.37 
 
 		 320 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  44.87 
 
 		 360 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  39.48 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  42.86 
 
 		 328 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  36.31 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  39.87 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  41.75 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  43.92 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  39.48 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  42.09 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  38.41 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  41.08 
 
 		 313 aa  225  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  40.58 
 
 		 321 aa  225  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  40.26 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  40.26 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  43.51 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  40.26 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  40.26 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  40.26 
 
 		 321 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  39.22 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  39.94 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  41.86 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  44.24 
 
 		 339 aa  222  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  36.31 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  37.71 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  37.85 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  38.89 
 
 		 322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  41.31 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  39.74 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  39.74 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  38.59 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  38.56 
 
 		 322 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  38.56 
 
 		 322 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  42.32 
 
 		 312 aa  218  7e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  44 
 
 		 328 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1647  Integral membrane protein TerC  41.97 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.409513  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  41.37 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  42.07 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  40.54 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  42.39 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  44.32 
 
 		 327 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  39.35 
 
 		 337 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  42.16 
 
 		 320 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  43.38 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  37.58 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  39.74 
 
 		 319 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  41.58 
 
 		 308 aa  209  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  37.94 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  38.26 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  40.41 
 
 		 322 aa  208  9e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  41.42 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  41.42 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  35.71 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  41 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  41.1 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  40.23 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10570  Integral membrane protein TerC family  44.79 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  41.61 
 
 		 354 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  34.94 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  36 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  36.53 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  43.98 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  42.57 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  39.54 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  37.7 
 
 		 328 aa  199  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  36.1 
 
 		 325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1943  Integral membrane protein TerC  39.04 
 
 		 332 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  38.26 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  38.78 
 
 		 327 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2297  Integral membrane protein TerC  36.9 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.610971  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  39.66 
 
 		 352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  40.13 
 
 		 344 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  42.71 
 
 		 373 aa  195  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  37.3 
 
 		 354 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  37.42 
 
 		 354 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  35.24 
 
 		 319 aa  195  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>