More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6644 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  100 
 
 
272 aa  529  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2820  methyltransferase type 11  39.32 
 
 
279 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219288  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0316  Methyltransferase type 11  38.57 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2798  methyltransferase type 11  30.57 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  39.55 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  40.3 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  39.85 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.45 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  30.72 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  49.07 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1091  methyltransferase type 11  34.33 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.117678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  26.88 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  42.57 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1091  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
206 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192231  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  43.1 
 
 
235 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  34.36 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  39.68 
 
 
457 aa  63.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  43.1 
 
 
235 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  43.1 
 
 
235 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 
240 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  30.89 
 
 
215 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  40.32 
 
 
337 aa  62.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
262 aa  62.4  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.63 
 
 
230 aa  62.4  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  39.45 
 
 
213 aa  62.4  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0734  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
264 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599547  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  40.18 
 
 
283 aa  62  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
225 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.66 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  38.71 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.25 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
206 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  34.83 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  37.1 
 
 
253 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  40 
 
 
254 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
265 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  37.78 
 
 
332 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  37.78 
 
 
341 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
210 aa  59.7  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
214 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  34.43 
 
 
263 aa  59.3  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2086  hypothetical protein  30.94 
 
 
207 aa  58.9  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  41.41 
 
 
307 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  37.06 
 
 
272 aa  58.9  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3065  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.69 
 
 
216 aa  58.9  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.59 
 
 
230 aa  58.9  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
328 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
328 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
328 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  30.22 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.71 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
210 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.11 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1843  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
209 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  45.83 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  39.18 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.63 
 
 
155 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  42.22 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  43.33 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  36.64 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.37 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.34 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
320 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  33.57 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 
215 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  37.82 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  43.33 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1939  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  39.02 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  41.11 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  36.36 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0272  methyltransferase type 11  40 
 
 
182 aa  57.4  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 
215 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  32.56 
 
 
206 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  37.08 
 
 
261 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  34.38 
 
 
202 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1364  methyltransferase type 11  41.76 
 
 
181 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.594154 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 
226 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4492  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.27 
 
 
218 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2712  putative phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  41.24 
 
 
226 aa  56.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870029  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  32.22 
 
 
253 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>