284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5632 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5632  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 296 aa  578  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.765574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0915  electron transport protein SCO1/SenC  71.43 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.836521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  58.58 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7198  electron transport protein SCO1/SenC  54.07 
 
 		 247 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.325684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3067  electron transport protein SCO1/SenC  45.86 
 
 		 216 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00232769  hitchhiker  0.00529609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1277  electron transport protein SCO1/SenC  38.53 
 
 		 220 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3024  electron transport protein SCO1/SenC  39.2 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  42.07 
 
 		 310 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1776  electron transport protein SCO1/SenC  41.61 
 
 		 209 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254998  normal  0.31988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  33.49 
 
 		 210 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  33.49 
 
 		 210 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  39.38 
 
 		 197 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  33.85 
 
 		 210 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  33.64 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  33.85 
 
 		 210 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  38.55 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  32.52 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  34.08 
 
 		 198 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  33.75 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  36.36 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  34.62 
 
 		 198 aa  97.4  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  39.07 
 
 		 219 aa  96.3  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  34.97 
 
 		 211 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  32.24 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  32.24 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 210 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  36.3 
 
 		 210 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  39.13 
 
 		 218 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 		 205 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  31.78 
 
 		 205 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  30.33 
 
 		 205 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  37.42 
 
 		 226 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  37.01 
 
 		 205 aa  92.4  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  38.41 
 
 		 232 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  38.41 
 
 		 219 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  34.93 
 
 		 210 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  38.41 
 
 		 232 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  38.41 
 
 		 232 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  38.41 
 
 		 232 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  38.41 
 
 		 219 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 		 191 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 		 187 aa  92  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  35.06 
 
 		 202 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 		 203 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  31.73 
 
 		 206 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  35.06 
 
 		 197 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  35.4 
 
 		 211 aa  90.5  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  33.97 
 
 		 205 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  38.19 
 
 		 221 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  33.57 
 
 		 210 aa  89.7  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  37.41 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 205 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  37.2 
 
 		 211 aa  87.8  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  32.68 
 
 		 219 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 212 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  38.68 
 
 		 207 aa  86.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 191 aa  86.7  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 		 205 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  34.12 
 
 		 195 aa  85.9  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  35.06 
 
 		 181 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  32.41 
 
 		 212 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  37.41 
 
 		 217 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  32.48 
 
 		 192 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  35.06 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  35.06 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  35.25 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  35.25 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  34.48 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  35.06 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  35.06 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  35.06 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  35.97 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  48 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  36.89 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  33.72 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  40.54 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  44.94 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  36.81 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  33.76 
 
 		 201 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  32.79 
 
 		 196 aa  82  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  34.35 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  32.21 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  41.38 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  38.74 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  40.54 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  42.47 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  31.5 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  35.97 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  35.97 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  35.97 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  31.16 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  36.51 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  34.85 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  33.05 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  31.4 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  35.07 
 
 		 206 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  44 
 
 		 211 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>