155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5229 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 368 aa  743    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.17 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  33.33 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  27.49 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  27.06 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  26.3 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  24.9 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  25.3 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  25.25 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  27.75 
 
 		 307 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 		 370 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  26.05 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  21.78 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 		 309 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247545 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  28.3 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  23.92 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  20.92 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.64 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 		 333 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  27.67 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.71 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.5 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  27.67 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  20 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  23.97 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.21 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  26.63 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.47 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  27.67 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  27.67 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  26.52 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  27.67 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.39 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  27.67 
 
 		 340 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  27.51 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  23.72 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 317 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.809623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 		 316 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.56 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.7 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.36 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  26.46 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2173  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0967474  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  24.36 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0386  NADH-ubiquinone oxidoreductase family protein  22.3 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.13 
 
 		 326 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0773  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.28 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.224338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  31 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.32 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469702  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.01 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34716  nad-dependent epimerase/dehydratase  22.64 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  27.81 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4100  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.05 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.32 
 
 		 325 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.84 
 
 		 321 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  39.73 
 
 		 211 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.24 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.83 
 
 		 335 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  27.81 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.73 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  32.38 
 
 		 295 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.16 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  24.08 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  23.13 
 
 		 321 aa  46.6  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  30.77 
 
 		 292 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>