More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4213 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5556  extracellular solute-binding protein  76.03 
 
 		 522 aa  661    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4213  4-phytase  100 
 
 		 416 aa  839    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4214  extracellular solute-binding protein  65.3 
 
 		 481 aa  564  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329164  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6358  extracellular solute-binding protein  62.47 
 
 		 519 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6256  extracellular solute-binding protein  62.41 
 
 		 522 aa  549  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0461  extracellular solute-binding protein  62.47 
 
 		 520 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4222  extracellular solute-binding protein  63.2 
 
 		 521 aa  535  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7148  extracellular solute-binding protein  64.1 
 
 		 531 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0874465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3398  extracellular solute-binding protein  61.26 
 
 		 528 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3920  extracellular solute-binding protein  60.48 
 
 		 523 aa  514  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.407855  normal  0.0244216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4852  extracellular solute-binding protein  62.23 
 
 		 525 aa  514  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213679  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2981  extracellular solute-binding protein  60.05 
 
 		 527 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3291  extracellular solute-binding protein  59.08 
 
 		 519 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3464  extracellular solute-binding protein  39.32 
 
 		 529 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3996  extracellular solute-binding protein family 5  32.93 
 
 		 536 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.70207  normal  0.0901295 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7529  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  31.44 
 
 		 541 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 521 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 517 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  29.1 
 
 		 517 aa  133  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 505 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  28 
 
 		 495 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 495 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0112  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 506 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 		 510 aa  130  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  27.54 
 
 		 523 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  28.95 
 
 		 551 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.99 
 
 		 515 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  28.21 
 
 		 524 aa  126  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 		 519 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  32.19 
 
 		 520 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 514 aa  123  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.68 
 
 		 513 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.76 
 
 		 521 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.76 
 
 		 521 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.76 
 
 		 521 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 521 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.76 
 
 		 521 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  31.02 
 
 		 527 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6369  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  56 
 
 		 306 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.25 
 
 		 535 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 512 aa  119  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 536 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 505 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 521 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  27.54 
 
 		 495 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.48 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.52 
 
 		 516 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  30.48 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.48 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.48 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  30.48 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.48 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.48 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.96 
 
 		 510 aa  117  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 520 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  31.09 
 
 		 514 aa  117  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 510 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.93 
 
 		 502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  30.48 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  26.52 
 
 		 527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 517 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 542 aa  114  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 518 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 		 520 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  26.77 
 
 		 514 aa  113  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 535 aa  113  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 528 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.33 
 
 		 550 aa  113  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 		 534 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.45 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.78 
 
 		 565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 607 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 520 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 520 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 527 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.47 
 
 		 492 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30 
 
 		 512 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.47 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30 
 
 		 512 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30 
 
 		 512 aa  111  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30 
 
 		 512 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 492 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  27.56 
 
 		 535 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 520 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 534 aa  109  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.07 
 
 		 517 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.64 
 
 		 524 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  29.08 
 
 		 520 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.68 
 
 		 512 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 		 512 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 551 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  29.68 
 
 		 512 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>