More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4067 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  100 
 
 		 603 aa  1149    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  52.35 
 
 		 537 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  53.54 
 
 		 563 aa  512  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  48.77 
 
 		 583 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  44.75 
 
 		 561 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  42.6 
 
 		 536 aa  341  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  43.33 
 
 		 585 aa  329  7e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  42.03 
 
 		 564 aa  315  9.999999999999999e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0909  ABC transporter related  44.02 
 
 		 563 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  32.89 
 
 		 547 aa  277  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1283  ABC transporter related  41.4 
 
 		 551 aa  274  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0227702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  35.8 
 
 		 546 aa  267  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  40.41 
 
 		 562 aa  264  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  37.46 
 
 		 548 aa  257  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  38.36 
 
 		 550 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  36.08 
 
 		 563 aa  255  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  39.7 
 
 		 552 aa  254  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  38.47 
 
 		 551 aa  251  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  38.04 
 
 		 566 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1328  ABC transporter related protein  37.73 
 
 		 553 aa  239  6.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651131  hitchhiker  0.00125797 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22700  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.48 
 
 		 600 aa  239  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25030  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.25 
 
 		 548 aa  228  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  30.49 
 
 		 641 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  26.7 
 
 		 643 aa  213  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.04 
 
 		 644 aa  209  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.59 
 
 		 639 aa  207  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  25.45 
 
 		 642 aa  206  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.06 
 
 		 560 aa  206  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  25.45 
 
 		 642 aa  206  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  30.69 
 
 		 641 aa  206  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.64 
 
 		 555 aa  204  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  26.54 
 
 		 540 aa  204  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  27.86 
 
 		 644 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.88 
 
 		 637 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.05 
 
 		 635 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  30.83 
 
 		 672 aa  202  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  30.78 
 
 		 637 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  30.78 
 
 		 637 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  30.78 
 
 		 637 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.78 
 
 		 637 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.78 
 
 		 637 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  29.33 
 
 		 653 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.78 
 
 		 637 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.78 
 
 		 637 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.78 
 
 		 637 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.07 
 
 		 559 aa  201  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.05 
 
 		 635 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.05 
 
 		 635 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.05 
 
 		 635 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.88 
 
 		 635 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.05 
 
 		 635 aa  200  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  35.12 
 
 		 545 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  29.69 
 
 		 555 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2616  ABC transporter related  36.88 
 
 		 540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  29.15 
 
 		 545 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  28.12 
 
 		 659 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.93 
 
 		 555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  34.39 
 
 		 551 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.02 
 
 		 559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  25.38 
 
 		 536 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.62 
 
 		 637 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.87 
 
 		 635 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  27.47 
 
 		 659 aa  197  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0889  ABC transporter related  31.47 
 
 		 554 aa  197  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.98 
 
 		 645 aa  197  7e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.39 
 
 		 553 aa  196  8.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  26.59 
 
 		 634 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21470  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  30.13 
 
 		 529 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  29.27 
 
 		 649 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  25.29 
 
 		 541 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  26.4 
 
 		 658 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  27.14 
 
 		 658 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  26.4 
 
 		 658 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  31.99 
 
 		 634 aa  195  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  26.4 
 
 		 640 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  27.3 
 
 		 644 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.67 
 
 		 640 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  26.4 
 
 		 658 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  26.4 
 
 		 658 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  36.18 
 
 		 542 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.67 
 
 		 640 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  29.82 
 
 		 544 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.67 
 
 		 640 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.73 
 
 		 560 aa  194  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  26.91 
 
 		 630 aa  194  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.94 
 
 		 560 aa  194  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  26.82 
 
 		 636 aa  194  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.61 
 
 		 550 aa  193  6e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  28.12 
 
 		 581 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.06 
 
 		 637 aa  194  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  24.54 
 
 		 541 aa  193  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  26.24 
 
 		 644 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.69 
 
 		 561 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  27.35 
 
 		 543 aa  193  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  27.61 
 
 		 645 aa  192  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  29.19 
 
 		 575 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  26.51 
 
 		 634 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  26.24 
 
 		 662 aa  192  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1522  ABC transporter related protein  30.35 
 
 		 556 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256666  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  31.3 
 
 		 574 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>