More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3497 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  100 
 
 
203 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  81 
 
 
203 aa  343  8e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  67.68 
 
 
299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  68 
 
 
202 aa  300  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  68 
 
 
200 aa  298  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  64.97 
 
 
204 aa  282  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  62.63 
 
 
204 aa  274  6e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  62.63 
 
 
208 aa  268  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  62.24 
 
 
226 aa  264  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  63.82 
 
 
200 aa  264  8e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  60 
 
 
209 aa  261  4.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  60 
 
 
209 aa  261  6.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  62.76 
 
 
207 aa  259  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  63.08 
 
 
207 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  60.61 
 
 
208 aa  258  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  63.08 
 
 
207 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  63.08 
 
 
207 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  59.6 
 
 
209 aa  258  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  62.12 
 
 
209 aa  256  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  57.43 
 
 
206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  59.28 
 
 
207 aa  252  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  61.5 
 
 
209 aa  252  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  59.6 
 
 
207 aa  251  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  59.5 
 
 
209 aa  244  9e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  59.89 
 
 
207 aa  241  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  58.55 
 
 
207 aa  239  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  55.05 
 
 
207 aa  238  5.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  47.94 
 
 
198 aa  198  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  47.96 
 
 
198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  42.86 
 
 
269 aa  195  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  45.88 
 
 
223 aa  190  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  46.6 
 
 
195 aa  186  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  44.9 
 
 
304 aa  184  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  46.88 
 
 
197 aa  184  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  44.9 
 
 
304 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31067  Mn-Superoxide dismutase  44.62 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.076255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  44.5 
 
 
304 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  44.5 
 
 
304 aa  182  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  44.5 
 
 
304 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  44.5 
 
 
304 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  44.5 
 
 
304 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  43.88 
 
 
304 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  44.5 
 
 
304 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  45.79 
 
 
226 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  44.39 
 
 
304 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  44.5 
 
 
304 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  42.35 
 
 
348 aa  181  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  47.96 
 
 
208 aa  180  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  47.96 
 
 
199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  42.78 
 
 
208 aa  177  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  42.29 
 
 
225 aa  176  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42832  mutase superoxide dismutase  43.37 
 
 
226 aa  174  8e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  46.35 
 
 
211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  41.33 
 
 
437 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  43.35 
 
 
223 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  36.18 
 
 
203 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  43.46 
 
 
223 aa  168  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  43.98 
 
 
205 aa  167  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  43.98 
 
 
199 aa  167  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  45.31 
 
 
214 aa  166  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1705  superoxide dismutase  42.49 
 
 
205 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  42.35 
 
 
206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  44.79 
 
 
211 aa  165  4e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  42.29 
 
 
205 aa  165  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  44.79 
 
 
211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  40.91 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  37.38 
 
 
206 aa  162  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  41.5 
 
 
205 aa  162  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  42.71 
 
 
209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  41.75 
 
 
200 aa  160  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  41.09 
 
 
204 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63831  manganese-superoxide dismutase  42.27 
 
 
208 aa  158  5e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34151  manganese-superoxide dismutase  41.54 
 
 
227 aa  158  6e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.096588  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  40.61 
 
 
200 aa  157  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  41.12 
 
 
204 aa  157  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_002620  TC0567  superoxide dismutase  39 
 
 
207 aa  155  6e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  40.2 
 
 
203 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0762  superoxide dismutase (Mn)  40.78 
 
 
201 aa  153  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0276674  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  38.61 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  40.91 
 
 
203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  39.6 
 
 
203 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1292  Superoxide dismutase  42.11 
 
 
211 aa  150  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  41.8 
 
 
203 aa  150  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  38.07 
 
 
200 aa  150  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  40 
 
 
261 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  37.06 
 
 
200 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  41.75 
 
 
193 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  41.24 
 
 
193 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  39.2 
 
 
203 aa  149  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  41.24 
 
 
193 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00785  mitochondrial superoxide dismutase (Eurofung)  39.39 
 
 
213 aa  148  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.852927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  39.39 
 
 
204 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  37.88 
 
 
209 aa  147  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  39.59 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1748  Superoxide dismutase  38 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  39.7 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  38.19 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0704  superoxide dismutase  40.51 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  37.56 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  39.59 
 
 
241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>