More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1570 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1570  GrpE protein  100 
 
 		 161 aa  311  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145005  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6428  GrpE protein  55 
 
 		 196 aa  122  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4434  GrpE protein  48.67 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2172  GrpE protein  52.98 
 
 		 224 aa  121  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.316744  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4023  GrpE protein  44.59 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0596565  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3590  GrpE protein  41.29 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00352283  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  40.94 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  39.24 
 
 		 260 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  40.27 
 
 		 208 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  39.19 
 
 		 213 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  36.03 
 
 		 189 aa  87  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  38.26 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  35.37 
 
 		 190 aa  86.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  35.4 
 
 		 188 aa  84.7  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  37.04 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  36.08 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  35.92 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  38.41 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  37.14 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  38.46 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  35.81 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  37.75 
 
 		 238 aa  81.3  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  37.14 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  34.69 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  38.26 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  35.06 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  36.43 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  34.93 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  30.41 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  36.53 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  35.17 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  32.41 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  40.28 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  32.89 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  34.42 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  34.51 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  35.33 
 
 		 206 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  37.13 
 
 		 205 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  34.9 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.95 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  35.33 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  28.83 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  33.77 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  32.65 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.66 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  33.11 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  35.12 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  34.06 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  36.25 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  37.25 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.29 
 
 		 243 aa  74.7  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  33.11 
 
 		 223 aa  73.9  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  37.65 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  35.9 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  33.77 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  41.01 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  33.99 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  32.45 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  33.77 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 		 188 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 		 188 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 		 188 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  33.99 
 
 		 196 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 		 188 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  33.99 
 
 		 197 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  35 
 
 		 203 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  33.57 
 
 		 192 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 		 188 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 		 206 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 		 206 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 		 206 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 		 206 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  33.99 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  33.99 
 
 		 197 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  33.99 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  33.99 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  33.99 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  31.88 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  36.05 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  33.99 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  31.03 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  37.76 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  37.13 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  34.34 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  32.86 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>