68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1393 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 87 aa  181  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  68.97 
 
 		 87 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  67.82 
 
 		 87 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.98 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.28 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  43.68 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  44.83 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  44.83 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.53 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  47.25 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.23 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  43.02 
 
 		 87 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  46.75 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  46.75 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.93 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.02 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.7 
 
 		 87 aa  67  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.78 
 
 		 87 aa  67  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  36.78 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  40.23 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.86 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  37.93 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.48 
 
 		 87 aa  62  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.58 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.59 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  34.48 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  34.07 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.44 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  31.4 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.66 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  34.48 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  36.05 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.56 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  30.95 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  33.73 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  32.95 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.89 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  27.91 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  35.14 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3326  CRISPR-associated protein Cas2  35.06 
 
 		 86 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.59 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1288  CRISPR-associated protein Cas2  36.9 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.566019  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 87 aa  47  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.57 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  34.29 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  30.11 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.03 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3908  hypothetical protein  37.14 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48914  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.13 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  39.13 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  30.68 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1424  CRISPR-associated protein Cas2  39.13 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.183922  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  36.23 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  37.68 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  34.94 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  35.14 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  39.13 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2002  CRISPR-associated protein Cas2  30.16 
 
 		 71 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0115  CRISPR-associated Cas2 family protein  26.83 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0035101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  29.63 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  30.53 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  41.43 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  33.73 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  32.18 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  30.12 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 95 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.06 
 
 		 96 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>