201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0419 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0419  integrase  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  89.22 
 
 		 299 aa  306  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  84.8 
 
 		 355 aa  303  9.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  85.38 
 
 		 182 aa  300  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  82.46 
 
 		 355 aa  297  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  82.46 
 
 		 355 aa  294  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  83.83 
 
 		 333 aa  294  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  82.46 
 
 		 355 aa  293  9e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  80.12 
 
 		 355 aa  288  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  81.93 
 
 		 359 aa  280  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  81.44 
 
 		 235 aa  277  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  83.23 
 
 		 303 aa  267  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  89.66 
 
 		 316 aa  263  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  82 
 
 		 147 aa  174  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  53.85 
 
 		 368 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  52.07 
 
 		 356 aa  171  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  52.66 
 
 		 368 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  52.1 
 
 		 368 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  50.9 
 
 		 368 aa  168  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  51.5 
 
 		 368 aa  167  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  90 
 
 		 236 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  52.07 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  47.9 
 
 		 395 aa  156  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  49.11 
 
 		 370 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  75.73 
 
 		 342 aa  154  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  47.4 
 
 		 357 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  86.67 
 
 		 81 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  42.68 
 
 		 347 aa  130  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  40 
 
 		 355 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  86.15 
 
 		 65 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  39.39 
 
 		 355 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3099  putative transposase  86.15 
 
 		 65 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  47.73 
 
 		 130 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  33.73 
 
 		 355 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  31.71 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  40.14 
 
 		 143 aa  97.1  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  31.71 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  56.63 
 
 		 172 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  52.08 
 
 		 96 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4390  hypothetical protein  83.02 
 
 		 98 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  31.43 
 
 		 364 aa  87.8  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  31.93 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  47.31 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  46.07 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  35.54 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  34.34 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  34.34 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  33.13 
 
 		 341 aa  68.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  38.24 
 
 		 106 aa  62  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  34.48 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  34.48 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  34.65 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  34.65 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  34.65 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  34.65 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  34.65 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0006  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 385 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000397696  normal  0.219937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2485  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 364 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 378 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 409 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 374 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 383 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1071  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 369 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000428907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2691  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 390 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3517  hypothetical protein  36.14 
 
 		 362 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0711  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 359 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000332452  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 373 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1853  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 385 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2305  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 386 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 411 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 373 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3080  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 371 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 390 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1702  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 364 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.431472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 379 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 390 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2714  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 362 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  0.786621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1159  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 358 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  decreased coverage  0.00186464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1990  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 360 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0292285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1394  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 376 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0489416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1352  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 379 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 378 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2429  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 366 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0896  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 359 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.366884  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 360 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 378 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 371 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 379 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0721  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 360 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208316  decreased coverage  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2064  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 365 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2198  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 364 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0375  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 431 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1366  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 361 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000904408  decreased coverage  0.0000712993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2732  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 378 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0455  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 371 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 367 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 378 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1541  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 356 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000437148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1497  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 355 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  hitchhiker  0.000449962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1690  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 358 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>