More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0344 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0344  ABC transporter related  100 
 
 		 336 aa  655    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.952475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  65.77 
 
 		 277 aa  330  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2040  ABC transporter related  67.97 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222981  normal  0.58442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5683  ABC transporter related  58.71 
 
 		 475 aa  291  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  57.41 
 
 		 276 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  57.36 
 
 		 261 aa  279  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  55.6 
 
 		 293 aa  276  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  55.6 
 
 		 275 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  55.6 
 
 		 275 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  55.6 
 
 		 275 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  54.83 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  56.64 
 
 		 333 aa  272  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  53.91 
 
 		 258 aa  268  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  55 
 
 		 334 aa  268  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  55.19 
 
 		 294 aa  268  8.999999999999999e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  52.96 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  48.82 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  53.58 
 
 		 280 aa  262  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  50.67 
 
 		 302 aa  262  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  50.79 
 
 		 262 aa  258  8e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  51.16 
 
 		 261 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  51.97 
 
 		 261 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  49.83 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  52.36 
 
 		 270 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  49.21 
 
 		 257 aa  252  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  52.76 
 
 		 259 aa  250  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  49.41 
 
 		 256 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  48.03 
 
 		 257 aa  245  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  52.9 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.03 
 
 		 254 aa  242  6e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  46.46 
 
 		 255 aa  242  7e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  46.69 
 
 		 263 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  51.37 
 
 		 262 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  48.03 
 
 		 265 aa  241  9e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  48.03 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  49.21 
 
 		 252 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1114  ABC transporter related  46.35 
 
 		 453 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0650865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1789  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.8 
 
 		 440 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1723  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.8 
 
 		 446 aa  239  6.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  50 
 
 		 255 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  49.61 
 
 		 265 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  49.61 
 
 		 265 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  44.8 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  49.05 
 
 		 262 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  48.43 
 
 		 255 aa  237  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  50 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  47.45 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.18 
 
 		 258 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  53.94 
 
 		 256 aa  235  7e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  49.18 
 
 		 258 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  49.18 
 
 		 258 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  49.18 
 
 		 258 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  51.71 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  46.88 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  46.27 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  45.35 
 
 		 265 aa  234  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  47.66 
 
 		 258 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  46.27 
 
 		 284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  49.8 
 
 		 259 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  51.18 
 
 		 273 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  47.45 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  49.6 
 
 		 612 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  47.64 
 
 		 270 aa  232  5e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3325  ABC transporter related  45.48 
 
 		 354 aa  232  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.268059  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  48.77 
 
 		 258 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  49.45 
 
 		 610 aa  232  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  48.08 
 
 		 256 aa  232  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  49.21 
 
 		 271 aa  232  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  46.85 
 
 		 259 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  45.67 
 
 		 252 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  49.8 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  45.91 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  49.81 
 
 		 590 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  48.77 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  50.2 
 
 		 257 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  49.81 
 
 		 260 aa  231  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.59 
 
 		 256 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  46.97 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  49.61 
 
 		 253 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  50.95 
 
 		 274 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.09 
 
 		 255 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  46.92 
 
 		 255 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  46.85 
 
 		 254 aa  230  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  45.88 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  43.19 
 
 		 256 aa  229  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  47.45 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1620  ABC transporter related  47.53 
 
 		 278 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  45.91 
 
 		 265 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  50.59 
 
 		 256 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  48.37 
 
 		 256 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.7 
 
 		 255 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  47.08 
 
 		 258 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 256 aa  228  8e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.45 
 
 		 258 aa  228  8e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 		 256 aa  228  9e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  47.24 
 
 		 264 aa  228  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  48.36 
 
 		 255 aa  228  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.31 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>