More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2040 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2040  ABC transporter related  100 
 
 		 278 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222981  normal  0.58442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0344  ABC transporter related  67.97 
 
 		 336 aa  331  9e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.952475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  60.78 
 
 		 277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  56.59 
 
 		 333 aa  265  5e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  53.91 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  53.91 
 
 		 293 aa  261  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  54.44 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  54.44 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  54.69 
 
 		 275 aa  258  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 294 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  53.31 
 
 		 334 aa  255  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  49.67 
 
 		 302 aa  255  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  48.21 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  50.58 
 
 		 259 aa  251  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  51.18 
 
 		 271 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  46.64 
 
 		 256 aa  248  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.61 
 
 		 256 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  246  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  49.81 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5683  ABC transporter related  52.45 
 
 		 475 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  50.2 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  50.19 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  49.03 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  47.91 
 
 		 261 aa  242  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  49.81 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  49.61 
 
 		 261 aa  242  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  48.06 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  49.22 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.41 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  50.59 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  49.22 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19620  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.37 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00232655  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  50.97 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  49 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.02 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  48.85 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  48.43 
 
 		 265 aa  239  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  46.48 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.4 
 
 		 258 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  50.94 
 
 		 280 aa  237  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.63 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.63 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  45.77 
 
 		 261 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  48.61 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 257 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  49.4 
 
 		 258 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  45.7 
 
 		 257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  46.74 
 
 		 257 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  49 
 
 		 258 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  48.06 
 
 		 258 aa  234  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  49 
 
 		 258 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  49 
 
 		 258 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 261 aa  234  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.24 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.03 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  47.83 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  49.03 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  48.41 
 
 		 258 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.64 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  49.01 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  47.31 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.21 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  47.31 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  49.03 
 
 		 256 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  48.25 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  46.36 
 
 		 257 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  49.8 
 
 		 270 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  50.58 
 
 		 271 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.46 
 
 		 255 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.06 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1836  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2141  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558111  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0865  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0775  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  46.25 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.46 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  50 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  49.41 
 
 		 270 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6414  ABC transporter related  50.2 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  47.47 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  47.43 
 
 		 253 aa  228  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.81 
 
 		 258 aa  228  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  46.95 
 
 		 260 aa  228  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.64 
 
 		 256 aa  228  8e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  47.84 
 
 		 256 aa  228  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.06 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  44.06 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  47.08 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  47.86 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.64 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.06 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  47.08 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  44.88 
 
 		 259 aa  226  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4334  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.64 
 
 		 255 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231493  normal  0.133886 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  42.19 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  45.85 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.6 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  50.6 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>