More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1482 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1482  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  618  1e-176  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1519  hypothetical protein  40 
 
 
331 aa  226  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0546  hypothetical protein  36.94 
 
 
318 aa  215  9e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1566  hypothetical protein  36.91 
 
 
321 aa  199  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1632  hypothetical protein  36.91 
 
 
321 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  36.81 
 
 
369 aa  85.9  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1491  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.961051  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  30.13 
 
 
436 aa  82.4  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  34.27 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.82 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  34.59 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  28.71 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  23.23 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  24.29 
 
 
464 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0039  permease  22.32 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  24.91 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1926  hypothetical protein  25.91 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  31.91 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3416  hypothetical protein  28.66 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  28.41 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  30.49 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  30.32 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  29.03 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  29.03 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5618  hypothetical protein  28.1 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  29.03 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  29.03 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5562  membrane protein YdbI  28.1 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5387  hypothetical protein  28.1 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.514486  normal  0.849251 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2059  protein of unknown function UPF0118  25.56 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  29.03 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2006  hypothetical protein  28.66 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.277817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5570  hypothetical protein  27.92 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2027  hypothetical protein  28.66 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0291717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1783  hypothetical protein  28.66 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5291  hypothetical protein  28.1 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1762  hypothetical protein  28.66 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0301209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5533  hypothetical protein  28.1 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5118  membrane protein  28.1 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1740  hypothetical protein  28.66 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5133  membrane protein  28.1 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000220099  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  33.11 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1922  hypothetical protein  28.66 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5688  hypothetical protein  28.1 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  21.47 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.29 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  29.06 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.29 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  29.06 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.29 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.29 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  29.06 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.29 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  33.08 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  27.63 
 
 
455 aa  69.7  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1958  hypothetical protein  28.66 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000222767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.11 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  29.06 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  33.08 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.11 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3955  hypothetical protein  27.85 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  26.27 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  27.49 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  24.25 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1483  hypothetical protein  26.83 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.82 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  24.25 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  22.49 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  24.13 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5231  hypothetical protein  25.56 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  29.22 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  23.92 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  33.59 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.43 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  33.08 
 
 
405 aa  67  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  26.19 
 
 
418 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  36.43 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0130  hypothetical protein  24.49 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  36.29 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.44 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3344  protein of unknown function UPF0118  25.65 
 
 
343 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  27.6 
 
 
383 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  28.57 
 
 
361 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  22.54 
 
 
416 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0566  hypothetical protein  23.71 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.0679598 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  27.56 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  28.86 
 
 
404 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  22.3 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  22.97 
 
 
368 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  27.51 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  28.86 
 
 
406 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  23.69 
 
 
355 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  24.53 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  28.79 
 
 
384 aa  63.9  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  28.17 
 
 
357 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  22.97 
 
 
368 aa  63.5  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  29.29 
 
 
392 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  27.52 
 
 
369 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>