87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0244 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0244  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  100 
 
 		 306 aa  620  1e-176  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.576373  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0878  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  50.83 
 
 		 299 aa  335  7e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00683705  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0746  hypothetical protein  51.49 
 
 		 300 aa  332  5e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0722  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  49.83 
 
 		 300 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  45.6 
 
 		 308 aa  312  3.9999999999999997e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000156737  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0341  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  45.83 
 
 		 323 aa  291  6e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0437  hypothetical protein  32.64 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0564  hypothetical protein  30.5 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.52849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3902  hypothetical protein  28.03 
 
 		 344 aa  122  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000029197  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1346  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.33 
 
 		 327 aa  119  6e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000809029  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0212  hypothetical protein  32.68 
 
 		 325 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000728433  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1466  hypothetical protein  28 
 
 		 322 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0764811  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0136  ABC transporter substrate-binding protein  28.79 
 
 		 330 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1738  hypothetical protein  28 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0611482  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2281  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.99 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2612  hypothetical protein  27.74 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0016523  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1558  hypothetical protein  25.23 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000039017  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1805  putative periplasmic component of ABC-type transport system  26.2 
 
 		 334 aa  99.4  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0502884  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1453  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.27 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.892723  normal  0.0689078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4036  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  24.53 
 
 		 331 aa  95.9  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.7213  normal  0.0122121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2687  putative periplasmic component of ABC-type transport system  23.42 
 
 		 376 aa  92.4  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130525  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4169  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.75 
 
 		 331 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3870  hypothetical protein  25.44 
 
 		 354 aa  89.7  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000795104  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0491  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.41 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00141878  normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0951  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.54 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00952521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0424  hypothetical protein  25.55 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1931  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  22.26 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.10366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0857  ABC-type transport system, periplasmic component  22.8 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9276  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  33.61 
 
 		 355 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0427  hypothetical protein  20.86 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  23.98 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1172  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.98 
 
 		 358 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811616  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3267  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.63 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4250  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.63 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.125058  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4116  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.63 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4146  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.29 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287587  normal  0.0410042 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  22.89 
 
 		 385 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2778  NMT1/THI5 like domain protein  26.48 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4340  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.63 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14770  NLPA lipoprotein  20.53 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3674  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.29 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.880422 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03210  hypothetical protein  25.38 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0198758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3571  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.2 
 
 		 357 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1182  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.71 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.794723  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.46 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1761  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.14 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3117  NLPA lipoprotein  26.47 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0213  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  29.2 
 
 		 393 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2516  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  23.81 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3780  NLPA lipoprotein  27.78 
 
 		 396 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31390  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  24.04 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356097  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2131  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.23 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7380  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  29.17 
 
 		 374 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4374  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.97 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  23.47 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0288  NMT1/THI5 like domain protein  23.24 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0490  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  20.97 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000043628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  24.3 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  25 
 
 		 460 aa  46.6  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.47 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  23.26 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.26 
 
 		 335 aa  46.2  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  25 
 
 		 328 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1379  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.79 
 
 		 312 aa  45.8  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0275994 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  25 
 
 		 328 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2816  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  30 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000863815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  26.32 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  26.06 
 
 		 529 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  25 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5229  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.28 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0533798  normal  0.0843496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2879  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  20.73 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  23 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2438  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  18.88 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3147  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.62 
 
 		 344 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3641  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.28 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1999  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.23 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0466  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  23.89 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0543  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.41 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4066  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0526  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.49 
 
 		 324 aa  43.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  25.97 
 
 		 457 aa  43.1  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1285  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.85 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0376066 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1573  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 326 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.817202  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  25.12 
 
 		 405 aa  42.7  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0085  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.06 
 
 		 350 aa  42.4  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  21.43 
 
 		 434 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>