60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3102 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 
582 aa  1202    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  25.31 
 
 
564 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.96 
 
 
603 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  25.56 
 
 
579 aa  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.99 
 
 
607 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  26.21 
 
 
603 aa  101  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.3 
 
 
589 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.67 
 
 
605 aa  92.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.56 
 
 
591 aa  87  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  23.84 
 
 
604 aa  85.5  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.55 
 
 
573 aa  80.5  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.03 
 
 
595 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  22.2 
 
 
663 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.49 
 
 
578 aa  63.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  28.44 
 
 
707 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  21.14 
 
 
648 aa  58.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  20.74 
 
 
681 aa  56.6  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  24.49 
 
 
529 aa  54.7  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  27.46 
 
 
555 aa  53.9  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  27.46 
 
 
555 aa  53.9  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  27.46 
 
 
555 aa  53.9  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  25.94 
 
 
552 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  25.94 
 
 
552 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  25.94 
 
 
552 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  25.94 
 
 
552 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  25.94 
 
 
552 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.16 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  26.16 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  26.16 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  26.16 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  26.16 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  26.16 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  26.16 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  26.16 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  26.16 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  27.33 
 
 
553 aa  52  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  26.29 
 
 
554 aa  52  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.01 
 
 
552 aa  51.6  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  21.18 
 
 
564 aa  51.2  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.91 
 
 
669 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  22.81 
 
 
666 aa  51.2  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  26.74 
 
 
553 aa  51.2  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  27.27 
 
 
554 aa  50.8  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  26.98 
 
 
554 aa  50.4  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  22.46 
 
 
728 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  25.52 
 
 
558 aa  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.08 
 
 
793 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.38 
 
 
652 aa  48.5  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  23.6 
 
 
691 aa  48.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.92 
 
 
677 aa  47.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.92 
 
 
677 aa  47.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  26.78 
 
 
574 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  23.36 
 
 
594 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  21.21 
 
 
714 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.27 
 
 
689 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  24.71 
 
 
642 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.24 
 
 
626 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2782  hypothetical protein  23.05 
 
 
440 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.22 
 
 
634 aa  44.3  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.73 
 
 
566 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>