107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1277 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1277  cytochrome B561  100 
 
 
232 aa  473  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.258136  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08530  Ni,Fe-hydrogenase I cytochrome b subunit  60.89 
 
 
229 aa  288  6e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.360929 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12930  hypothetical protein  61.9 
 
 
106 aa  137  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.871854  normal  0.293906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.49 
 
 
207 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2031  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.66 
 
 
222 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.172243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1887  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.93 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1913  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.93 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.400664  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1920  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.93 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2406  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.93 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0991035  hitchhiker  0.000275557 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2105  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.19 
 
 
222 aa  79  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2157  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.41 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71471  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1878  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.41 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1820  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.41 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2097  quinone-reactive Ni/Fe hydrogenase, cytochrome b subunit  29.38 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2090  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.38 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.427939  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3908  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.25 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1763  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.9 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1906  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.77 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0142953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0874  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.73 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  28.02 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2321  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.39 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0938  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  27.57 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3146  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.91 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0114554  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3330  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  27.51 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0460  quinone-reactive Ni/Fe hydrogenase, cytochrome b subunit  27.46 
 
 
238 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000119026  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1401  quinone-reactive Ni/Fe hydrogenase, cytochrome b subunit  26.42 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1281  quinone-reactive Ni/Fe hydrogenase, cytochrome b subunit  25.91 
 
 
238 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00387154  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1677  quinone-reactive Ni/Fe hydrogenase, cytochrome b subunit  28.65 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0121  nickel-iron hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.32 
 
 
222 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.347229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  29.56 
 
 
210 aa  55.1  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0714  Ni/Fe hydrogenase, cytochrome b subunit  25.25 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.72466  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  27.69 
 
 
201 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1591  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.67 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0543  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.94 
 
 
218 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  26.73 
 
 
214 aa  52.4  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  28.87 
 
 
217 aa  52.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  28.44 
 
 
242 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0336  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.26 
 
 
244 aa  52  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00129504  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  27.49 
 
 
242 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1104  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.9 
 
 
225 aa  52  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1434  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  27.66 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.237376  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1901  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  26.13 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2175  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.34 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000847396  normal  0.136379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  26.07 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  23.35 
 
 
210 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3405  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.13 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.788903  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0835  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.85 
 
 
234 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  24.88 
 
 
198 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2130  cytochrome B561  29.08 
 
 
390 aa  49.3  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.578698  normal  0.698297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  24.37 
 
 
280 aa  48.9  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  25.82 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  26.15 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0863  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  25.5 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.627078  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  26.37 
 
 
213 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  25.27 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  24.49 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  24.37 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  23.35 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0163  nickel-iron hydrogenase, small subunit  27.27 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.979082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3987  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  23.86 
 
 
234 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3369  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.4 
 
 
240 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00901378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  23.71 
 
 
210 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1860  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.75 
 
 
227 aa  46.2  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  23.2 
 
 
210 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  23.2 
 
 
210 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  27.78 
 
 
201 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  25.5 
 
 
224 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2027  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.27 
 
 
240 aa  45.4  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  25.25 
 
 
212 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  25 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11260  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase  28.42 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  24.49 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  24.87 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  27.66 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  24.02 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2341  hydrogenase 1 b-type cytochrome subunit  25 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.334235  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0677  cytochrome B561  26.47 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00977  hydrogenase 1, b-type cytochrome subunit  25 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112521  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2670  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0583865  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0974  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.74 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000584739  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1082  hydrogenase 1 b-type cytochrome subunit  25 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1089  hydrogenase 1 b-type cytochrome subunit  25 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0131135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  24.75 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2622  hydrogenase 1 b-type cytochrome subunit  25 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2143  hydrogenase 1 b-type cytochrome subunit  24.5 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.187945  normal  0.482264 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1210  hydrogenase 1 b-type cytochrome subunit  25 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  24.89 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00984  hypothetical protein  25 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.143558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0690  cytochrome B561  26.96 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  24.74 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1367  cytochrome B561  25.53 
 
 
390 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0962  hypothetical protein  26.5 
 
 
222 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  26.5 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0855  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.15 
 
 
229 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.34705 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1448  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  25.13 
 
 
227 aa  42.7  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0615119  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3100  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.22 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2713  cytochrome B561  29.44 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2865  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.1 
 
 
235 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  25.37 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2387  cytochrome B561  25.87 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.549561  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>