More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3303 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  100 
 
 		 338 aa  696    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  72.78 
 
 		 338 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3320  hypothetical protein  73.37 
 
 		 338 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.915678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3244  hypothetical protein  73.08 
 
 		 338 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3425  hypothetical protein  72.49 
 
 		 338 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.955308  hitchhiker  0.00600667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  55.92 
 
 		 340 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  55.92 
 
 		 340 aa  378  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  55.62 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.62 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  55.62 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  55.62 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  55.62 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  55.92 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  55.33 
 
 		 340 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.85 
 
 		 340 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.55 
 
 		 340 aa  368  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  53.55 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  43.03 
 
 		 356 aa  274  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.07 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.16 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.48 
 
 		 338 aa  269  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 		 335 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  43.07 
 
 		 341 aa  262  8e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.53 
 
 		 335 aa  261  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 		 345 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.29 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  39.29 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  41.12 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.47 
 
 		 337 aa  251  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 		 336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  38.6 
 
 		 336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.9 
 
 		 337 aa  246  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  40.4 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  39.12 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 		 338 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.28 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1260  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.99 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.785941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.46 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0286  alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 		 330 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1608  putative Zn-dependent dehydrogenase  35.99 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.587808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0262  alcohol dehydrogenase  35.99 
 
 		 327 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0577  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 		 342 aa  202  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.105265  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.74 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.06 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  30.9 
 
 		 339 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.2 
 
 		 339 aa  172  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  31.2 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  31.2 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  33.88 
 
 		 347 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  30.9 
 
 		 339 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  30.9 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.56 
 
 		 341 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  31.76 
 
 		 352 aa  166  8e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.57 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  30.03 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.11 
 
 		 342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  30.5 
 
 		 339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2811  alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 		 347 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  33.87 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  29.62 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  30.7 
 
 		 347 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  33.71 
 
 		 288 aa  159  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.15 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.6 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  30.41 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  30.41 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.41 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  30.41 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.82 
 
 		 347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  30.12 
 
 		 347 aa  155  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4595  hypothetical protein  33.02 
 
 		 348 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  31.12 
 
 		 343 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  30.12 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  29.53 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.55 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  29.52 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2235  alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 		 340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000256926  hitchhiker  0.0000000000711864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  30.96 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  29.33 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.22 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  29.33 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  29.33 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  29.33 
 
 		 339 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  33.33 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2473  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.96 
 
 		 344 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  30.86 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  31.71 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  31.91 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.33 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.45 
 
 		 347 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4454  alcohol dehydrogenase  31.61 
 
 		 345 aa  149  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>