56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2215 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  98.63 
 
 
219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  98.63 
 
 
219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  98.63 
 
 
219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  98.63 
 
 
219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  99.09 
 
 
219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  98.17 
 
 
219 aa  443  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  61.64 
 
 
224 aa  286  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  60.91 
 
 
225 aa  278  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  60.91 
 
 
225 aa  278  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  66.2 
 
 
254 aa  268  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  53.74 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  54.21 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  54.21 
 
 
224 aa  232  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  53.99 
 
 
230 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  53.55 
 
 
218 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  48.57 
 
 
1204 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  46.98 
 
 
233 aa  185  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  41.89 
 
 
222 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  42.99 
 
 
222 aa  161  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  41.82 
 
 
233 aa  154  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  40.19 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  32.26 
 
 
212 aa  89.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  32.04 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  30.48 
 
 
219 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  29.83 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  29.83 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  29.83 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  31.18 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  28.95 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  34.39 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  27.66 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  27.66 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  27.66 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  33.02 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  31.79 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  35.42 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  37.9 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  35.42 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  34.72 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  25.53 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  26.75 
 
 
343 aa  65.1  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  29.49 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  28.27 
 
 
352 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  36.07 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  29.38 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  28.12 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1510  hypothetical protein  26.15 
 
 
154 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.836921  normal  0.0611826 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  29.29 
 
 
268 aa  51.6  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  30.06 
 
 
272 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>