21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1510 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1510  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  312  8e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.836921  normal  0.0611826 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  30 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  26.85 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 		 1204 aa  54.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  23.89 
 
 		 225 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  23.89 
 
 		 225 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 		 233 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  25.25 
 
 		 254 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  26.15 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.15 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  26.15 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  25.38 
 
 		 222 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  26.15 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  26.15 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  26.15 
 
 		 219 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  26.15 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.15 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.15 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  26.62 
 
 		 230 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  22.97 
 
 		 224 aa  43.9  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  25.66 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>