180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2189 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2189  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
303 aa  630  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2861  glycosyl transferase family 2  55.23 
 
 
305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2313  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  55.41 
 
 
314 aa  335  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0276977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2311  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  55.41 
 
 
314 aa  335  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0283502  normal  0.0363291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2424  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  55.41 
 
 
314 aa  335  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.126367  hitchhiker  0.000645643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2210  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  54.43 
 
 
314 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  47.37 
 
 
305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  41.86 
 
 
308 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  41.86 
 
 
308 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2354  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.2 
 
 
308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2138  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 
308 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.177505  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0841  glycosyl transferase family protein  43.33 
 
 
306 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.913833  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  43.33 
 
 
309 aa  245  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  39.8 
 
 
303 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3560  glycosyl transferase family protein  37.71 
 
 
306 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480294  normal  0.632112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3008  glycosyl transferase  40.13 
 
 
303 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  39.6 
 
 
313 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3103  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
322 aa  162  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.532387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0596  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.42 
 
 
304 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.300556  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 
327 aa  92.4  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 
1061 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  27.07 
 
 
1162 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  29.26 
 
 
1161 aa  73.2  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  24.21 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 
1124 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
324 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  23.35 
 
 
360 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
525 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 
415 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
423 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  23.66 
 
 
291 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
423 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 
345 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
320 aa  58.9  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 
338 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2839  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
314 aa  57  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0441317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  23.25 
 
 
528 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  23.93 
 
 
430 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  23.5 
 
 
335 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  25.59 
 
 
461 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  23.62 
 
 
748 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
748 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  24.07 
 
 
403 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
274 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 
841 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  23.01 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
366 aa  53.9  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
507 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  23.19 
 
 
650 aa  53.9  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  23.53 
 
 
411 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  23.73 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
1077 aa  53.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
428 aa  53.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 
1267 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2444  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 
320 aa  52.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181475  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.93 
 
 
336 aa  52.8  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  22.62 
 
 
331 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 
1267 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  22.31 
 
 
322 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  21.93 
 
 
334 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  26.6 
 
 
664 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  22.55 
 
 
581 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 
513 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  23.28 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  26.47 
 
 
749 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 
340 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  22.33 
 
 
320 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  25.38 
 
 
1118 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.73 
 
 
341 aa  50.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
958 aa  50.1  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
1739 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  22.51 
 
 
313 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 
1002 aa  49.7  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 
345 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  21.69 
 
 
315 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 
324 aa  49.3  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 
924 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
403 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  22.12 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2402  hypothetical protein  27.08 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  22.27 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  20.27 
 
 
477 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  20.82 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  24.26 
 
 
497 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0448  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0726747  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  22.32 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  22.64 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  20.89 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  22.44 
 
 
752 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  20.89 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.1 
 
 
247 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  29.1 
 
 
247 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3846  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
311 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  22.02 
 
 
341 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  22.62 
 
 
310 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>