41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3103 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3103  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
322 aa  669    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.532387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  35.33 
 
 
313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2210  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  36.36 
 
 
314 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
305 aa  180  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3560  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
306 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480294  normal  0.632112 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2424  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  35.74 
 
 
314 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.126367  hitchhiker  0.000645643 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2313  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  35.74 
 
 
314 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0276977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2311  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  35.74 
 
 
314 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0283502  normal  0.0363291 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
308 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  31.48 
 
 
308 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 
309 aa  169  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2861  glycosyl transferase family 2  37.55 
 
 
305 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2189  glycosyl transferase, group 2 family protein  36 
 
 
303 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
303 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2354  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.28 
 
 
308 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2138  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
308 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.177505  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3008  glycosyl transferase  32.38 
 
 
303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0596  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.97 
 
 
304 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.300556  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0841  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
306 aa  135  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.913833  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.95 
 
 
1161 aa  87.4  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  34.83 
 
 
1162 aa  87  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
1061 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2839  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0441317  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
994 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.92 
 
 
336 aa  49.7  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0043  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  20.93 
 
 
282 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
340 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  22.78 
 
 
528 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 
1739 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  22.17 
 
 
322 aa  46.2  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  22.7 
 
 
477 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  22.17 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  22.08 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 
322 aa  43.5  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
335 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>