238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3560 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3560  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
306 aa  631  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480294  normal  0.632112 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  48.84 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  48.84 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  49 
 
 
303 aa  278  9e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2210  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  44.55 
 
 
314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2313  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  43.23 
 
 
314 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0276977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2311  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  43.23 
 
 
314 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0283502  normal  0.0363291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2424  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  43.23 
 
 
314 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.126367  hitchhiker  0.000645643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2138  glycosyl transferase family protein  44.67 
 
 
308 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.177505  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2354  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.33 
 
 
308 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3008  glycosyl transferase  46.86 
 
 
303 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  42.81 
 
 
305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  39.8 
 
 
309 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2861  glycosyl transferase family 2  42.19 
 
 
305 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2189  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.71 
 
 
303 aa  219  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0841  glycosyl transferase family protein  39.02 
 
 
306 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.913833  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  34.64 
 
 
313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3103  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
322 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.532387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0596  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.06 
 
 
304 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.300556  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2839  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0441317  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  29.13 
 
 
1161 aa  77  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
1061 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  28.45 
 
 
1162 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  23.12 
 
 
403 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  28.38 
 
 
418 aa  64.3  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  23.49 
 
 
321 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  28.08 
 
 
418 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  28.22 
 
 
417 aa  60.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  24.75 
 
 
1124 aa  60.1  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  28 
 
 
1101 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
477 aa  59.3  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2444  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181475  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  26.32 
 
 
633 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
507 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 
345 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  25.6 
 
 
662 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
423 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.73 
 
 
505 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  25.73 
 
 
520 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
423 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
235 aa  55.8  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
433 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
337 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
509 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 
1267 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  25.59 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  21.79 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  21.79 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
520 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
1002 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  23.96 
 
 
1099 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
520 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
520 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
509 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  24.09 
 
 
752 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
335 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
300 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  21.68 
 
 
528 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 
322 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  26.89 
 
 
323 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  22.32 
 
 
340 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  22.01 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
307 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 
505 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 
509 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3289  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 
573 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 
573 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 
1120 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 
494 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 
316 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  23.23 
 
 
442 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 
345 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  24.86 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  22.47 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
446 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
924 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 
346 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  22.81 
 
 
339 aa  49.3  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  21.14 
 
 
320 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 
332 aa  49.3  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  22.11 
 
 
461 aa  49.3  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  24.45 
 
 
366 aa  49.3  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
428 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  22.9 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  25.27 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  23.23 
 
 
444 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  27.61 
 
 
362 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  23.23 
 
 
444 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>