243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0330 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0330  DNA methylase family protein  100 
 
 		 402 aa  831    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00332873  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  25.56 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  28.83 
 
 		 570 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  28.22 
 
 		 554 aa  66.6  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  29.11 
 
 		 495 aa  66.6  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  26.79 
 
 		 506 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  27.23 
 
 		 526 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  23.45 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  24.66 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  23.66 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  26.01 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  32.33 
 
 		 527 aa  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  26.34 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  23.21 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  25.11 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  27.19 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  28.22 
 
 		 553 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  28.22 
 
 		 553 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  22.99 
 
 		 730 aa  62.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  27.19 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  27.19 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  27.19 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  25.45 
 
 		 526 aa  61.6  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  25.69 
 
 		 540 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  29.63 
 
 		 545 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  24.2 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  25.33 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  28.77 
 
 		 518 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  25.23 
 
 		 493 aa  60.1  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  25.35 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  30.3 
 
 		 508 aa  60.1  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0636  N-6 DNA methylase  25.18 
 
 		 545 aa  59.7  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  24.29 
 
 		 513 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  27.64 
 
 		 1005 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  23.14 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  27.74 
 
 		 579 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  26.36 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.26 
 
 		 654 aa  58.9  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  25.82 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  24.69 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1218  N-6 DNA methylase  26.27 
 
 		 544 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  25.11 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  28.33 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  25 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  24.2 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  28.24 
 
 		 544 aa  57  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  23.85 
 
 		 533 aa  57  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  28.24 
 
 		 544 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  22.88 
 
 		 501 aa  56.6  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  22.38 
 
 		 523 aa  56.6  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  28.75 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1201  N-6 DNA methylase  21.25 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721125  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  22.61 
 
 		 500 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  24.02 
 
 		 768 aa  56.2  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  26.41 
 
 		 534 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  24.67 
 
 		 489 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0084  N-6 DNA methylase  21.43 
 
 		 495 aa  55.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  25.56 
 
 		 950 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  24.67 
 
 		 489 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  27.19 
 
 		 871 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  22.38 
 
 		 508 aa  55.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  23.95 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  25.94 
 
 		 495 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  22.27 
 
 		 498 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  21.4 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4393  type I restriction-modification system, M subunit  26.38 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  23.18 
 
 		 506 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  27.62 
 
 		 517 aa  54.7  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 528 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.87 
 
 		 548 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  24.09 
 
 		 481 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  27.78 
 
 		 530 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  22.78 
 
 		 510 aa  54.7  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  22.57 
 
 		 493 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1457  type I restriction-modification system, M subunit, putative  31.13 
 
 		 684 aa  54.3  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  25.58 
 
 		 522 aa  54.3  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  24.31 
 
 		 847 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3524  N-6 DNA methylase  24 
 
 		 549 aa  54.3  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636426  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  22.9 
 
 		 908 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  24.11 
 
 		 527 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  23.96 
 
 		 504 aa  53.9  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  21.68 
 
 		 489 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  26.29 
 
 		 535 aa  53.9  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3517  N-6 DNA methylase  21.93 
 
 		 486 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2478  N-6 DNA methylase  29.71 
 
 		 881 aa  53.9  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  26.98 
 
 		 525 aa  53.5  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  24.06 
 
 		 554 aa  53.5  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 506 aa  53.5  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 810 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1499  type I restriction-modification system, M subunit  23.26 
 
 		 521 aa  53.5  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  25.11 
 
 		 834 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  29.06 
 
 		 810 aa  53.5  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  23.15 
 
 		 799 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  21.95 
 
 		 484 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  27.71 
 
 		 547 aa  53.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  22.88 
 
 		 485 aa  53.1  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  24.89 
 
 		 537 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  25 
 
 		 574 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  26.72 
 
 		 544 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0548  N-6 DNA methylase  24.56 
 
 		 541 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>