More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_4178 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  61.52 
 
 		 550 aa  691    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  98.37 
 
 		 551 aa  1133    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  100 
 
 		 551 aa  1147    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  98.37 
 
 		 551 aa  1133    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  99.27 
 
 		 551 aa  1137    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  98.37 
 
 		 551 aa  1133    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  38.39 
 
 		 524 aa  349  6e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  36.14 
 
 		 508 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  32.99 
 
 		 505 aa  220  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  33.2 
 
 		 505 aa  220  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  35.97 
 
 		 510 aa  219  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  31.25 
 
 		 470 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  30.59 
 
 		 440 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  32.39 
 
 		 517 aa  207  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  31.19 
 
 		 508 aa  206  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  31.85 
 
 		 544 aa  203  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  34.15 
 
 		 521 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  30.1 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  29.44 
 
 		 547 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  30.41 
 
 		 502 aa  197  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  30.08 
 
 		 548 aa  196  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  30.22 
 
 		 513 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  29.45 
 
 		 552 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  30.53 
 
 		 526 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  30 
 
 		 542 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  30.93 
 
 		 545 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  31.13 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  30.81 
 
 		 554 aa  191  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  32.24 
 
 		 556 aa  190  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  32.1 
 
 		 546 aa  190  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  28.8 
 
 		 496 aa  189  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  30.69 
 
 		 496 aa  189  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  29.45 
 
 		 555 aa  188  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  28.71 
 
 		 557 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  32.21 
 
 		 522 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  30 
 
 		 552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  31.12 
 
 		 556 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  30.33 
 
 		 567 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  30.89 
 
 		 579 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  31.57 
 
 		 525 aa  184  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  30.71 
 
 		 555 aa  180  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  30.1 
 
 		 560 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  29.26 
 
 		 496 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  30.87 
 
 		 564 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  29.3 
 
 		 522 aa  178  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  31.15 
 
 		 561 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  30.43 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  28.94 
 
 		 512 aa  173  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  29.84 
 
 		 561 aa  173  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  29.7 
 
 		 554 aa  173  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  29.43 
 
 		 549 aa  171  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  29.45 
 
 		 512 aa  170  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  28.43 
 
 		 512 aa  170  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  30.06 
 
 		 590 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  28.21 
 
 		 514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  28.21 
 
 		 514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  30.94 
 
 		 569 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  28.23 
 
 		 525 aa  163  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  29.02 
 
 		 526 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  30.55 
 
 		 462 aa  161  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  30.43 
 
 		 479 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  29.7 
 
 		 569 aa  160  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  30.94 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3111  arylsulfatase precursor  27.01 
 
 		 533 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.513855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4344  sulfatase  28.06 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  28.83 
 
 		 491 aa  157  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  27.4 
 
 		 523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  31.66 
 
 		 487 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  31.13 
 
 		 472 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  27.88 
 
 		 526 aa  151  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  28.29 
 
 		 480 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  30.37 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  32.11 
 
 		 520 aa  148  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  28.12 
 
 		 500 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  30.02 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  26.8 
 
 		 506 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  29.26 
 
 		 523 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  28.25 
 
 		 522 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  30.07 
 
 		 533 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  29.51 
 
 		 506 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  27.89 
 
 		 553 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  27.71 
 
 		 627 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  27.38 
 
 		 520 aa  136  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  28.44 
 
 		 523 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  27.45 
 
 		 481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  29.06 
 
 		 555 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  26.33 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  31.25 
 
 		 490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  28.02 
 
 		 453 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01456  hypothetical protein  27.1 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2148  sulfatase  27.1 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.541761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  26.69 
 
 		 503 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2159  sulfatase  27.1 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01469  hypothetical protein  27.1 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  26.83 
 
 		 440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1583  sulfatase  27.1 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096723  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  26.86 
 
 		 539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1675  sulfatase  27.1 
 
 		 539 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  29.78 
 
 		 484 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  30.07 
 
 		 559 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>