More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1933 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1933  ABC transporter related protein  100 
 
 		 249 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0971316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01678  vitamin B12-transporter ATPase  99.2 
 
 		 249 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0384865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1922  vitamin B12-transporter ATPase  99.6 
 
 		 249 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2427  vitamin B12-transporter ATPase  99.2 
 
 		 249 aa  500  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.516886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01667  hypothetical protein  99.2 
 
 		 249 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1789  vitamin B12-transporter ATPase  99.6 
 
 		 249 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1928  vitamin B12-transporter ATPase  99.6 
 
 		 249 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000867694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1481  vitamin B12-transporter ATPase  99.6 
 
 		 249 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1913  vitamin B12-transporter ATPase  99.2 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1470  vitamin B12-transporter ATPase  80.97 
 
 		 249 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1831  vitamin B12-transporter ATPase  81.48 
 
 		 245 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2003  vitamin B12-transporter ATPase  80.97 
 
 		 249 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1437  vitamin B12-transporter ATPase  81.48 
 
 		 245 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0281162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1453  vitamin B12-transporter ATPase  81.48 
 
 		 245 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1733  vitamin B12-transporter ATPase  69.88 
 
 		 251 aa  358  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2153  vitamin B12-transporter ATPase  50 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2773  vitamin B12-transporter ATPase  49.37 
 
 		 242 aa  229  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2467  vitamin B12-transporter ATPase  49.6 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1722  vitamin B12-transporter ATPase  45.57 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.630088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1627  ABC transporter related  45.02 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1830  vitamin B12-transporter ATPase  45.57 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2614  vitamin B12-transporter ATPase  45.57 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1656  ABC transporter related  49.33 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0865  vitamin B12-transporter ATPase  45.61 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.232587  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003686  vitamin B12 ABC transporter ATPase component BtuD  39.29 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02133  vitamin B12-transporter ATPase  38.74 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02204  vitamin B12-transporter ATPase  33.19 
 
 		 311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01538  ABC-type hemin transport system, ATPase component  36.78 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.554253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  36.56 
 
 		 266 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  36.12 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.1 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  31.01 
 
 		 405 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3755  ABC transporter related  37.05 
 
 		 269 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  35.87 
 
 		 293 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  36.36 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  35.96 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  33.18 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1490  ABC transporter related  34 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  31.25 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  36.12 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  36.07 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  37.18 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  30.52 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  31.4 
 
 		 276 aa  111  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  37.84 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.63 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  32.27 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  37.28 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  32.56 
 
 		 258 aa  109  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  33.07 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  31.72 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  32.89 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  36.32 
 
 		 255 aa  108  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  36.53 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  36.7 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  37.84 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  32.33 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  34.19 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  34.19 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  34.08 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  35.94 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.62 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.84 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  31.36 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  35.22 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  37.27 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  34.84 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  34.72 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  30.51 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2207  ABC transporter related  37.56 
 
 		 279 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.215656 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  28.74 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  34.58 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2665  ABC transporter related  37.1 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  32.49 
 
 		 418 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  34.98 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0840  ABC transporter related  35.9 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  30.34 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  35.54 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  36.12 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0077  ABC transporter related protein  37.73 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0023  ABC transporter related  38.33 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  31.36 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  35.02 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  33.91 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  36.22 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1298  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  31.06 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0252271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.06 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  35.96 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  33.33 
 
 		 444 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  32.46 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  34.23 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  34.51 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  34.51 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  34.23 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  32.19 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  34.51 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>