More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1490 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1490  ABC transporter related  100 
 
 		 278 aa  569  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01538  ABC-type hemin transport system, ATPase component  40.29 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.554253  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  34.52 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  33.97 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  29.79 
 
 		 418 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  33.21 
 
 		 255 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  33.21 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  31.77 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  33.59 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  34.22 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  34.7 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  33.33 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  30.58 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  34.64 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  32.95 
 
 		 455 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  32.83 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  32.06 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  33.56 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  33.21 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  33.92 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  31.14 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  31.88 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  34.33 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  32.88 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  36.59 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  33.96 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  32.36 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  32 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  32.97 
 
 		 270 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  34.92 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  34.92 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  34.92 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  32.88 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  32.88 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  32.88 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  30.53 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  30.83 
 
 		 251 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  30.63 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  30.92 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  32 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  31.38 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  32.18 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  35.57 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  32.35 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  31.9 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  29.29 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.93 
 
 		 253 aa  136  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  30.92 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  30.85 
 
 		 285 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  30.15 
 
 		 288 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  30.15 
 
 		 272 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  31.39 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  31.15 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  30.15 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  34 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  30.15 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0298  ABC transporter related  31.82 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  30.19 
 
 		 268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  30.85 
 
 		 253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  30.92 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  27.7 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  30.74 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  32.58 
 
 		 444 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  31.58 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  30.94 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  27.3 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  29.78 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  30.96 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  30.57 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  31.58 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4372  ABC transporter related  28.46 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  33.46 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4653  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  28.68 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2427  vitamin B12-transporter ATPase  34.4 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.516886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  29.41 
 
 		 274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  30.18 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0434  hemin importer ATP-binding subunit  32.17 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  29.19 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01678  vitamin B12-transporter ATPase  34.4 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0384865  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01667  hypothetical protein  34.4 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0246388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1830  hemin importer ATP-binding subunit  32.17 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  30.99 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1775  hemin importer ATP-binding subunit  32.17 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0341  hemin importer ATP-binding subunit  32.17 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853045  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  31.18 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2096  hemin importer ATP-binding subunit  32.17 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0830  hemin importer ATP-binding subunit  32.17 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1121  hemin importer ATP-binding subunit  32.17 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.402824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  29.69 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  27.86 
 
 		 414 aa  129  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  30.77 
 
 		 255 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  30.65 
 
 		 254 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  29.66 
 
 		 262 aa  128  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  31.18 
 
 		 282 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  31.18 
 
 		 282 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1789  vitamin B12-transporter ATPase  34 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841153  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  28.03 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1913  vitamin B12-transporter ATPase  34 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  30.53 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  29.17 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>