59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3888 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3888  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  800    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  68.29 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  50.63 
 
 
444 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  50.62 
 
 
926 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  34.13 
 
 
489 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  49.4 
 
 
484 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  41.25 
 
 
1261 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  40.74 
 
 
630 aa  65.9  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  46.67 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  28.57 
 
 
928 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  37.5 
 
 
897 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  54.72 
 
 
613 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  30.28 
 
 
407 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6484  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.67 
 
 
1257 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  32.98 
 
 
5185 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  27.72 
 
 
991 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  39.81 
 
 
539 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  36.17 
 
 
522 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23491  hypothetical protein  48.75 
 
 
480 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0449  hypothetical protein  54.72 
 
 
611 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00263959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0459  hypothetical protein  54.72 
 
 
611 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0872017  normal  0.526818 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  51.95 
 
 
3471 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  35.23 
 
 
1197 aa  49.7  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  51.95 
 
 
3472 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  45.07 
 
 
344 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  51.95 
 
 
3521 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2196  acriflavin resistance protein  32.14 
 
 
1335 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  33.04 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.36 
 
 
257 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  29.03 
 
 
1567 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  27.78 
 
 
1225 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.06 
 
 
445 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  32 
 
 
433 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  47.13 
 
 
2313 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  31.58 
 
 
1281 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  37.65 
 
 
453 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22510  hypothetical protein  36.27 
 
 
608 aa  46.6  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.818778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  37.66 
 
 
7149 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2374  glycosy hydrolase family protein  50.94 
 
 
535 aa  46.2  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0936  hypothetical protein  36.67 
 
 
3677 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.17 
 
 
830 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  43.48 
 
 
525 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.58 
 
 
261 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4281  cell surface protein  20 
 
 
953 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.533345  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1296  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  43.75 
 
 
550 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354374  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  27.27 
 
 
772 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.19 
 
 
1318 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  38.71 
 
 
481 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1025  DNA translocase FtsK  32.69 
 
 
1321 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.68582  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1059  DNA translocase FtsK  32.69 
 
 
1379 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0994  DNA translocase FtsK  32.69 
 
 
1360 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.208263  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  32.18 
 
 
489 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0549  hypothetical protein  42.86 
 
 
501 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3858  rhs element Vgr protein  43.02 
 
 
258 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.72 
 
 
2507 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  38.46 
 
 
701 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03550  hypothetical protein  43.86 
 
 
1602 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  23.88 
 
 
1416 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.52 
 
 
1162 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>