262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3062 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 468 aa  906    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  68.91 
 
 		 440 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  63.37 
 
 		 441 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  52.01 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  52.01 
 
 		 445 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  52.01 
 
 		 445 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  52.23 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  53.18 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  51.12 
 
 		 442 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  51.69 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  51.69 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  50.34 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  51.46 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  51.46 
 
 		 444 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  50.88 
 
 		 438 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  55.5 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  50.36 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  52.07 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  51.75 
 
 		 472 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  51.65 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  54.08 
 
 		 437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  52.31 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  49.88 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  53.42 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  50.36 
 
 		 449 aa  381  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  47.63 
 
 		 443 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  45.15 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  45.3 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  44.37 
 
 		 434 aa  364  2e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  46.02 
 
 		 494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  44.42 
 
 		 438 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  44.81 
 
 		 438 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  44.81 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  44.81 
 
 		 438 aa  362  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  44.81 
 
 		 438 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  44.81 
 
 		 438 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  44.42 
 
 		 438 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  44.42 
 
 		 493 aa  354  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  44.2 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  46.08 
 
 		 443 aa  352  5.9999999999999994e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  43.2 
 
 		 459 aa  336  5e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  43.2 
 
 		 459 aa  336  5e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  45.13 
 
 		 458 aa  336  7e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  42.89 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  42.99 
 
 		 431 aa  325  8.000000000000001e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  43.81 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  40.67 
 
 		 439 aa  309  8e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  41.24 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  41.2 
 
 		 437 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  34.68 
 
 		 431 aa  300  5e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  40.23 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  43.19 
 
 		 423 aa  292  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  35.76 
 
 		 447 aa  277  3e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  38.1 
 
 		 425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  42.65 
 
 		 441 aa  265  8.999999999999999e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  38.26 
 
 		 444 aa  242  7.999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  33.74 
 
 		 462 aa  241  2e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  35.98 
 
 		 443 aa  241  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  26.93 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2820  Na+/H+ antiporter NhaC  25 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.609382  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  26.67 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4193  Na+/H+ antiporter NhaC  32.02 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4030  Na+/H+ antiporter NhaC  32.02 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.623571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3863  Na+/H+ antiporter  32.02 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3877  Na+/H+ antiporter  32.02 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.335407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4256  Na+/H+ antiporter NhaC  32.02 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4345  Na+/H+ antiporter NhaC  32.02 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4146  Na+/H+ antiporter NhaC  32.02 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  34.97 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1552  Na+/H+ antiporter NhaC  23.14 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  36.21 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0226  Na+/H+ antiporter NhaC  27.44 
 
 		 494 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117171  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3953  Na+/H+ antiporter NhaC  36.07 
 
 		 457 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02004  putative Na+/H+ antiporter NnaC  27.3 
 
 		 491 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.194925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4232  Na+/H+ antiporter NhaC  32.02 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1004  Na+/H+ antiporter NhaC  32.02 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  25.86 
 
 		 484 aa  72  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1043  Na+/H+ antiporter NhaC  27.84 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2671  Na+/H+ antiporter NhaC  36.21 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  24.46 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1769  Na+/H+ antiporter NhaC  29.52 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.679407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  24.46 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  30.58 
 
 		 567 aa  70.9  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  24.28 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0548  Na+/H+ antiporter NhaC  35.26 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0362545  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  36.23 
 
 		 513 aa  69.7  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  36.5 
 
 		 521 aa  69.7  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  29.85 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  31.45 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  33.09 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0133  NahC family Na(+)/H(+) antiporter  33.58 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1496  Na+/H+ antiporter  26.95 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  30.82 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  30.06 
 
 		 557 aa  66.6  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0605  Na+/H+ antiporter NhaC  36.36 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1629  Na+/H+ antiporter NhaC  32.67 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.835214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2723  Na+/H+ antiporter NhaC  23.97 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  35.85 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  32.61 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0199  Na+/H+ antiporter NhaC  31.85 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>