136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1872 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1872  Acetamidase/Formamidase  100 
 
 		 429 aa  872    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1338  Acetamidase/Formamidase  65.81 
 
 		 434 aa  579  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.702518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2184  Acetamidase/Formamidase  64.4 
 
 		 434 aa  568  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3284  Acetamidase/Formamidase  60.84 
 
 		 443 aa  509  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148354  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3508  acetamidase/formamidase  58.14 
 
 		 440 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3153  acetamidase/formamidase  57.91 
 
 		 440 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.121817 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4177  acetamidase/formamidase  57.67 
 
 		 438 aa  501  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.390389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2080  acetamidase/formamidase  49.77 
 
 		 438 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5699  acetamidase/formamidase  49.06 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2642  Acetamidase/Formamidase  47.81 
 
 		 437 aa  421  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0651  Acetamidase/Formamidase  46.7 
 
 		 438 aa  420  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2016  Acetamidase/Formamidase  46.88 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.62129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  30.5 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  29.63 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  26.24 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  28.67 
 
 		 304 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  29.86 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  28.89 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  28.89 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  28.89 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  28.89 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  34.19 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  28.15 
 
 		 304 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  35.92 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  27.33 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 810 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  37.76 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  27.41 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  31.73 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  35.04 
 
 		 329 aa  57  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  27.55 
 
 		 791 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  32.5 
 
 		 329 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  26.79 
 
 		 485 aa  54.7  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  35.09 
 
 		 330 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  37.31 
 
 		 303 aa  54.3  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  22.68 
 
 		 438 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  34.34 
 
 		 340 aa  53.9  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  22.68 
 
 		 438 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  22.68 
 
 		 379 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  39.39 
 
 		 305 aa  53.5  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  35.82 
 
 		 429 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  35.82 
 
 		 429 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  35.82 
 
 		 429 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  35.82 
 
 		 429 aa  53.5  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  25.87 
 
 		 491 aa  53.5  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  45.76 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  25.66 
 
 		 791 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  40 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  38 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  39.58 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  36.11 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  34.71 
 
 		 350 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  38.1 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  37.31 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  40 
 
 		 311 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  38.81 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  37.5 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  41.18 
 
 		 300 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  45.76 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  26.83 
 
 		 318 aa  50.8  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  33.65 
 
 		 408 aa  51.2  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  36.84 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  38.24 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  25.17 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  38.96 
 
 		 409 aa  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  29.71 
 
 		 315 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  24.84 
 
 		 410 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  22.35 
 
 		 412 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  22.35 
 
 		 412 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  24.73 
 
 		 479 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  38.46 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  24.56 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  38.95 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  37.66 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 777 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  40 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  23.1 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  40 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  26.75 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  25.18 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 844 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  35.82 
 
 		 299 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  33 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  38.46 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  24 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  37.89 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  25.84 
 
 		 315 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  38.95 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 791 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  37.65 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  34.33 
 
 		 311 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  38.98 
 
 		 310 aa  47.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  41.79 
 
 		 298 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  35.82 
 
 		 322 aa  47.4  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  25.6 
 
 		 360 aa  47  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  35.82 
 
 		 345 aa  46.6  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  36.92 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  30.97 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  37.31 
 
 		 359 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>