64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2143 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  99.77 
 
 		 2895 bp  872    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2143    100 
 
 		 444 bp  880    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  99.55 
 
 		 2967 bp  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  92.12 
 
 		 2967 bp  603  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1575    90.77 
 
 		 1881 bp  555  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6002    90.77 
 
 		 675 bp  555  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  90.77 
 
 		 2967 bp  555  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  90.77 
 
 		 2967 bp  555  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  90.77 
 
 		 2967 bp  555  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  90.77 
 
 		 2967 bp  555  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  90.32 
 
 		 2967 bp  539  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  90.09 
 
 		 2967 bp  531  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  90.25 
 
 		 486 bp  533  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  90.09 
 
 		 2967 bp  531  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  90.21 
 
 		 795 bp  529  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  89.86 
 
 		 1020 bp  523  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  89.86 
 
 		 2970 bp  523  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1297    89.86 
 
 		 1016 bp  523  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3476    88.24 
 
 		 2978 bp  446  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  86.29 
 
 		 2973 bp  383  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  86.29 
 
 		 2973 bp  383  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1409    89.46 
 
 		 765 bp  381  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  85.59 
 
 		 2973 bp  373  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  85.59 
 
 		 2268 bp  373  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  85.59 
 
 		 2973 bp  373  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  85.59 
 
 		 2973 bp  373  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  85.59 
 
 		 2973 bp  373  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  85.36 
 
 		 2973 bp  365  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  90.44 
 
 		 2967 bp  333  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  89.96 
 
 		 2967 bp  319  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  89.96 
 
 		 768 bp  319  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  89.96 
 
 		 1821 bp  319  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  89.96 
 
 		 612 bp  319  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0157    89.96 
 
 		 1755 bp  319  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336177  normal  0.717019 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  89.96 
 
 		 933 bp  319  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  89.34 
 
 		 2967 bp  309  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  89.34 
 
 		 2967 bp  309  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  83.22 
 
 		 2967 bp  287  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  83.22 
 
 		 2967 bp  287  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  82.86 
 
 		 2970 bp  240  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15410    89.85 
 
 		 201 bp  232  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  9.49822e-18  unclonable  4.892999999999999e-22 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  85.66 
 
 		 3048 bp  230  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2295    85.86 
 
 		 1066 bp  170  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1488  hypothetical protein  92.56 
 
 		 168 bp  168  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0200539  normal  0.398384 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  81.99 
 
 		 2967 bp  89.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  81.99 
 
 		 2967 bp  89.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  81.99 
 
 		 2967 bp  89.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  79.2 
 
 		 2958 bp  83.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1120    85.57 
 
 		 811 bp  81.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1039  hypothetical protein  87.32 
 
 		 93 bp  69.9  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0914  hypothetical protein  87.69 
 
 		 162 bp  65.9  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4366  TnpA family transposase  97.14 
 
 		 339 bp  61.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.914851 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3243  Tn3 family transposase  100 
 
 		 381 bp  52  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1277  Tn3 family transposase  100 
 
 		 381 bp  52  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3995  Tn3 family transposase  100 
 
 		 381 bp  52  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2055  hypothetical protein  91.11 
 
 		 132 bp  50.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  90 
 
 		 2952 bp  48.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  93.75 
 
 		 2991 bp  48.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1102    93.75 
 
 		 6388 bp  48.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  93.75 
 
 		 2991 bp  48.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0844    96.43 
 
 		 249 bp  48.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  93.75 
 
 		 2991 bp  48.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  93.75 
 
 		 2991 bp  48.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 		 2442 bp  46.1  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>