62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1455 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  100 
 
 
269 aa  548  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  57.35 
 
 
272 aa  301  8.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  32.95 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  32.52 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  32.52 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  29.36 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  32.39 
 
 
175 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  29.63 
 
 
251 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  34.59 
 
 
182 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  33.04 
 
 
173 aa  52  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2541  protein of unknown function DUF955  24.42 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.24198  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  29.61 
 
 
370 aa  50.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 
165 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  31.78 
 
 
173 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  26.06 
 
 
355 aa  48.9  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  36.45 
 
 
215 aa  48.9  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1348  hypothetical protein  29.01 
 
 
142 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  35.92 
 
 
174 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  34.02 
 
 
147 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1728  protein of unknown function DUF955  37.04 
 
 
331 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  39.36 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  32.39 
 
 
156 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  33.08 
 
 
390 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  25.68 
 
 
186 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  31.09 
 
 
490 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  28.57 
 
 
354 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  31.67 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  29.46 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3460  hypothetical protein  36 
 
 
142 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0627917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3546  prophage LambdaBa01, repressor protein  36 
 
 
142 aa  45.4  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3830  prophage LambdaBa01, repressor protein  36 
 
 
142 aa  45.4  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  31.78 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3466  hypothetical protein  36 
 
 
142 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  27.86 
 
 
160 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  27.06 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  28.95 
 
 
395 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0309  hypothetical protein  33.33 
 
 
392 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  29.6 
 
 
366 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  33.6 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  39.47 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  34.23 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  31.65 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  32.2 
 
 
385 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  26.19 
 
 
294 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  38.57 
 
 
182 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1020  hypothetical protein  24.65 
 
 
141 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000136149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0629  hypothetical protein  28.97 
 
 
144 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  27.27 
 
 
357 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  30.08 
 
 
372 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0553  hypothetical protein  28.97 
 
 
144 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000331234 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  42.37 
 
 
216 aa  42.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1009  hypothetical protein  48.15 
 
 
319 aa  42.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  30.22 
 
 
372 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  27.42 
 
 
355 aa  42.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  42.37 
 
 
216 aa  42.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  40.82 
 
 
409 aa  42  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  30.71 
 
 
355 aa  42.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  30.69 
 
 
399 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  30.94 
 
 
188 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4415  hypothetical protein  29.47 
 
 
144 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>