150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4177 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3508  acetamidase/formamidase  83.41 
 
 		 440 aa  751    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3153  acetamidase/formamidase  83.41 
 
 		 440 aa  752    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.121817 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4177  acetamidase/formamidase  100 
 
 		 438 aa  893    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.390389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1338  Acetamidase/Formamidase  61.21 
 
 		 434 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.702518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2184  Acetamidase/Formamidase  60.28 
 
 		 434 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3284  Acetamidase/Formamidase  63.49 
 
 		 443 aa  525  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148354  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1872  Acetamidase/Formamidase  57.67 
 
 		 429 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2642  Acetamidase/Formamidase  53.38 
 
 		 437 aa  480  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2016  Acetamidase/Formamidase  51.84 
 
 		 435 aa  477  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.62129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5699  acetamidase/formamidase  52.35 
 
 		 439 aa  471  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0651  Acetamidase/Formamidase  51.98 
 
 		 438 aa  473  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2080  acetamidase/formamidase  51.89 
 
 		 438 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  32.84 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  34.58 
 
 		 304 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  31.82 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  30.97 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  26.78 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  38.81 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  31.86 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  30.32 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  31.78 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  32.71 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  30.32 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  29.03 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  31.78 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  38.89 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  31.78 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  31.78 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  31.78 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  31.78 
 
 		 304 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  43.28 
 
 		 301 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  31.78 
 
 		 304 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  29.2 
 
 		 304 aa  59.7  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  28.98 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  32.5 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  31.62 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  29.31 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  31.87 
 
 		 303 aa  57  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  30.83 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  43.24 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  36.92 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  36.67 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  41.89 
 
 		 409 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  41.89 
 
 		 409 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  41.89 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  41.89 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  35.09 
 
 		 315 aa  53.5  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  33.56 
 
 		 410 aa  53.5  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  32.46 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  39.19 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  37.31 
 
 		 299 aa  53.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  32.48 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  37.84 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  37.84 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  40.3 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  37.84 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  37.31 
 
 		 318 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  29.17 
 
 		 314 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  32.5 
 
 		 451 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  27.4 
 
 		 481 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  32.46 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  24.82 
 
 		 485 aa  50.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 		 418 aa  50.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  33.02 
 
 		 305 aa  50.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  35.14 
 
 		 411 aa  50.1  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 844 aa  50.1  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  31.53 
 
 		 305 aa  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  25.87 
 
 		 416 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  25.87 
 
 		 416 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  28.45 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  37.84 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  28.45 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  28.45 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  37.31 
 
 		 322 aa  49.7  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 777 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  39.71 
 
 		 300 aa  49.7  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 810 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  38.81 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  40 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  37.84 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  35.14 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  35.71 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  24.07 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  37.84 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  23.73 
 
 		 491 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  32.34 
 
 		 366 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  25.4 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  35.9 
 
 		 408 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  30.23 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  36.92 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  40.68 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  25.35 
 
 		 456 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  31.74 
 
 		 337 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  37.84 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  32.34 
 
 		 337 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  38.96 
 
 		 775 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  37.84 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>